研究Discovery Saga

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【化学】複合化学：耐熱性／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】生物学：超好熱性アーキア／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【生物学】生物学：超好熱性／超好熱菌を含む研究件

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【生物学】生物学：微生物工学／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【生物学】生物学：炭酸同化酵素／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / Pyrobaculum islandicum / 炭酸同化酵素 / フェレドキシン / 系統進化 (他6件)

【概要】超好熱菌は原始生化学反応を推し量る格好の材料であり、特にその酸化還元反応を司る電子伝達系の構造機能相関の究明は、生物のエネルギー代謝の共通原理を理解するうえで重要と考えられる一方、これまで効率よい培養法が確立されにくい調達困難な研究対象だった。ところが、最近申請者らの開発した系によって簡易な装置で充分な細胞量が安定に得られるようになった。そこで本研究は、超好熱菌と原始生物からの初期系統との関連を知...

【生物学】生物学：独立栄養生物／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / Pyrobaculum islandicum / 炭酸同化酵素 / フェレドキシン / 系統進化 (他6件)

【概要】超好熱菌は原始生化学反応を推し量る格好の材料であり、特にその酸化還元反応を司る電子伝達系の構造機能相関の究明は、生物のエネルギー代謝の共通原理を理解するうえで重要と考えられる一方、これまで効率よい培養法が確立されにくい調達困難な研究対象だった。ところが、最近申請者らの開発した系によって簡易な装置で充分な細胞量が安定に得られるようになった。そこで本研究は、超好熱菌と原始生物からの初期系統との関連を知...

【生物学】生物学：Pyrobaculum islandicum ／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / Pyrobaculum islandicum / 炭酸同化酵素 / フェレドキシン / 系統進化 (他6件)

【概要】超好熱菌は原始生化学反応を推し量る格好の材料であり、特にその酸化還元反応を司る電子伝達系の構造機能相関の究明は、生物のエネルギー代謝の共通原理を理解するうえで重要と考えられる一方、これまで効率よい培養法が確立されにくい調達困難な研究対象だった。ところが、最近申請者らの開発した系によって簡易な装置で充分な細胞量が安定に得られるようになった。そこで本研究は、超好熱菌と原始生物からの初期系統との関連を知...

【生物学】基礎生物学：Missing gene ／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【生物学】基礎生物学：ゲノム発現／超好熱菌を含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【生物学】基礎生物学：アーキア／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【生物学】基礎生物学：ジャイレース／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：NDK ／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：全生物の共通祖先／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：祖先型／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：祖先型酵素／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：機能進化／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：真正細菌／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：TCA回路／超好熱菌を含む研究件

❏超好熱性アーキアへのFd依存型嫌気的TCAサイクルの実装と水素生産への利用(22H02235)

【研究期間】2022-04-01 - 2026-03-31

【キーワード】超好熱菌 / Thermococcus / 水素生産 / TCA回路

【生物学】基礎生物学：グリシルtRNA合成酵素／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：IPMDH ／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【生物学】基礎生物学：系統進化／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / Pyrobaculum islandicum / 炭酸同化酵素 / フェレドキシン / 系統進化 (他6件)

【概要】超好熱菌は原始生化学反応を推し量る格好の材料であり、特にその酸化還元反応を司る電子伝達系の構造機能相関の究明は、生物のエネルギー代謝の共通原理を理解するうえで重要と考えられる一方、これまで効率よい培養法が確立されにくい調達困難な研究対象だった。ところが、最近申請者らの開発した系によって簡易な装置で充分な細胞量が安定に得られるようになった。そこで本研究は、超好熱菌と原始生物からの初期系統との関連を知...

【生物学】人類学：環境適応／超好熱菌を含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【生物学】人類学：進化／超好熱菌を含む研究件

【生物学】人類学：多様性／超好熱菌を含む研究件

【工学】総合工学：水素／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【総合生物】生体分子化学：炭酸固定／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】炭酸固定 / Rubisco / ATP-citrate lyase / ビオチン / カルボキシラーゼ (他12件)

【概要】HD-1株において、4種類のbiotin化タンパク(130kDa-BP、120kDa-BP、70kDa-BP、19kDa-BP、BP=Biotinylated Protein)の存在が示唆された。120kDa-BPの遺伝子を単離し、その塩基配列を決定した結果、推定分子量121.4kDa、1154aaをコードする3462bpから成る単一のORF上に、acetyl-CoA carboxylaseに特徴...

【総合生物】生体分子化学：リブロースビスリン酸カルボキシラーゼ／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】炭酸固定 / Rubisco / ATP-citrate lyase / ビオチン / カルボキシラーゼ (他12件)

【概要】HD-1株において、4種類のbiotin化タンパク(130kDa-BP、120kDa-BP、70kDa-BP、19kDa-BP、BP=Biotinylated Protein)の存在が示唆された。120kDa-BPの遺伝子を単離し、その塩基配列を決定した結果、推定分子量121.4kDa、1154aaをコードする3462bpから成る単一のORF上に、acetyl-CoA carboxylaseに特徴...

【総合生物】生体分子化学：ATP-citrate lyase ／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】炭酸固定 / Rubisco / ATP-citrate lyase / ビオチン / カルボキシラーゼ (他12件)

【概要】HD-1株において、4種類のbiotin化タンパク(130kDa-BP、120kDa-BP、70kDa-BP、19kDa-BP、BP=Biotinylated Protein)の存在が示唆された。120kDa-BPの遺伝子を単離し、その塩基配列を決定した結果、推定分子量121.4kDa、1154aaをコードする3462bpから成る単一のORF上に、acetyl-CoA carboxylaseに特徴...

【総合生物】生体分子化学：嫌気的炭酸固定／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】炭酸固定 / Rubisco / ATP-citrate lyase / ビオチン / カルボキシラーゼ (他12件)

【概要】HD-1株において、4種類のbiotin化タンパク(130kDa-BP、120kDa-BP、70kDa-BP、19kDa-BP、BP=Biotinylated Protein)の存在が示唆された。120kDa-BPの遺伝子を単離し、その塩基配列を決定した結果、推定分子量121.4kDa、1154aaをコードする3462bpから成る単一のORF上に、acetyl-CoA carboxylaseに特徴...

【総合生物】生体分子化学：遺伝子機能解明／超好熱菌を含む研究件

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【総合生物】生体分子化学：proteome ／超好熱菌を含む研究件

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【総合生物】生体分子化学：始原菌／超好熱菌を含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【総合生物】生体分子化学：カルボキシラーゼ／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】炭酸固定 / Rubisco / ATP-citrate lyase / ビオチン / カルボキシラーゼ (他12件)

【概要】HD-1株において、4種類のbiotin化タンパク(130kDa-BP、120kDa-BP、70kDa-BP、19kDa-BP、BP=Biotinylated Protein)の存在が示唆された。120kDa-BPの遺伝子を単離し、その塩基配列を決定した結果、推定分子量121.4kDa、1154aaをコードする3462bpから成る単一のORF上に、acetyl-CoA carboxylaseに特徴...

【総合生物】生体分子化学：新規代謝系／超好熱菌を含む研究件

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【総合生物】神経科学：生物・生体工学／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【総合生物】実験動物学：トランスポゾン／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【農学】農芸化学：超好熱古細菌／超好熱菌を含む研究件

【農学】農芸化学：遺伝子破壊／超好熱菌を含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【農学】農芸化学：古細菌／超好熱菌を含む研究件

【概要】翻訳系酵素(GlyRS)、代謝系酵素(IPMDHとNDK)、複製系酵素(ジャイレース)の祖先型酵素を作製した。翻訳系と複製系の酵素に関して、細菌祖先型酵素の作製に成功し、高度好熱菌よりも高い耐熱性を持つことが明らかとなった。代謝系酵素では、以前より研究を進めていたNDK に関していくつかの変異酵素を作製することにより、細菌、古細菌、全生物共通祖先の祖先型酵素が何れも非常に高い(100℃以上)耐熱性...

【キーワード】炭酸固定 / Rubisco / ATP-citrate lyase / ビオチン / カルボキシラーゼ (他12件)

【概要】HD-1株において、4種類のbiotin化タンパク(130kDa-BP、120kDa-BP、70kDa-BP、19kDa-BP、BP=Biotinylated Protein)の存在が示唆された。120kDa-BPの遺伝子を単離し、その塩基配列を決定した結果、推定分子量121.4kDa、1154aaをコードする3462bpから成る単一のORF上に、acetyl-CoA carboxylaseに特徴...

【農学】農芸化学：機能未知遺伝子／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【農学】農芸化学：TCAサイクル／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【農学】農芸化学：Thermococcus ／超好熱菌を含む研究件

❏超好熱性アーキアへのFd依存型嫌気的TCAサイクルの実装と水素生産への利用(22H02235)

【研究期間】2022-04-01 - 2026-03-31

【キーワード】超好熱菌 / Thermococcus / 水素生産 / TCA回路

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【農学】農芸化学：代謝改変／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【農学】農芸化学：水素生産／超好熱菌を含む研究件

❏超好熱性アーキアへのFd依存型嫌気的TCAサイクルの実装と水素生産への利用(22H02235)

【研究期間】2022-04-01 - 2026-03-31

【キーワード】超好熱菌 / Thermococcus / 水素生産 / TCA回路

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【農学】農芸化学：フェレドキシン／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / Pyrobaculum islandicum / 炭酸同化酵素 / フェレドキシン / 系統進化 (他6件)

【概要】超好熱菌は原始生化学反応を推し量る格好の材料であり、特にその酸化還元反応を司る電子伝達系の構造機能相関の究明は、生物のエネルギー代謝の共通原理を理解するうえで重要と考えられる一方、これまで効率よい培養法が確立されにくい調達困難な研究対象だった。ところが、最近申請者らの開発した系によって簡易な装置で充分な細胞量が安定に得られるようになった。そこで本研究は、超好熱菌と原始生物からの初期系統との関連を知...

【農学】生産環境農学：ルビスコ／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】炭酸固定 / Rubisco / ATP-citrate lyase / ビオチン / カルボキシラーゼ (他12件)

【概要】HD-1株において、4種類のbiotin化タンパク(130kDa-BP、120kDa-BP、70kDa-BP、19kDa-BP、BP=Biotinylated Protein)の存在が示唆された。120kDa-BPの遺伝子を単離し、その塩基配列を決定した結果、推定分子量121.4kDa、1154aaをコードする3462bpから成る単一のORF上に、acetyl-CoA carboxylaseに特徴...

【農学】水圏応用科学：比較ゲノム／超好熱菌を含む研究件

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【医歯薬学】内科系臨床医学：ビオチン／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】炭酸固定 / Rubisco / ATP-citrate lyase / ビオチン / カルボキシラーゼ (他12件)

【概要】HD-1株において、4種類のbiotin化タンパク(130kDa-BP、120kDa-BP、70kDa-BP、19kDa-BP、BP=Biotinylated Protein)の存在が示唆された。120kDa-BPの遺伝子を単離し、その塩基配列を決定した結果、推定分子量121.4kDa、1154aaをコードする3462bpから成る単一のORF上に、acetyl-CoA carboxylaseに特徴...

【医歯薬学】内科系臨床医学：ゲノム科学／超好熱菌を含む研究件

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【医歯薬学】社会医学：DNAチップ／超好熱菌を含む研究件

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【医歯薬学】薬学：タンパク質／超好熱菌を含む研究件

【医歯薬学】薬学：発現制御／超好熱菌を含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【医歯薬学】看護学：ウイルス／超好熱菌を含む研究件

【医歯薬学】看護学：ゲノム／超好熱菌を含む研究件

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【医歯薬学】看護学：メタボローム解析／超好熱菌を含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【医歯薬学】看護学：シグナル伝達／超好熱菌を含む研究件