研究Discovery Saga

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【生物学】生物学：組み換え体酵素／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【生物学】生物学：Pyrococcus furiosus ／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【生物学】生物学：RNAリガーゼ／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【生物学】生物学：RNA連結／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【生物学】生物学：tRNA前駆体／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【生物学】生物学：翻訳装置／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【生物学】生物学：超好熱性／アーキアを含む研究件

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【生物学】生物学：微生物工学／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【生物学】基礎生物学：Missing gene ／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【生物学】基礎生物学：ゲノム発現／アーキアを含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【生物学】基礎生物学：超好熱菌／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【生物学】基礎生物学：tRNA ／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【生物学】基礎生物学：遺伝情報／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【生物学】人類学：環境適応／アーキアを含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【工学】総合工学：水素／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【総合生物】生体分子化学：生体機能物質／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【総合生物】生体分子化学：遺伝情報伝達系／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【総合生物】生体分子化学：RNAプロセシング／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【総合生物】生体分子化学：Thermococcales ／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【総合生物】生体分子化学：極限環境／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【総合生物】生体分子化学：極限環境生命／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【総合生物】生体分子化学：炭酸固定／アーキアを含む研究件

❏アーキアによる極限環境下の炭酸固定(10460036)

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究代表者】五十嵐泰夫東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (90114363)

【研究期間】1998 - 1999

【キーワード】アーキア / 炭酸固定

【概要】アーキアにおける炭酸固定を明らかにする目的で、好塩アーキアとしてHalofeluxのRubisCOを、また好熱アーキアとしてAcidianusの新規炭酸固定経路に関して以下の実験を行った。 (A)まず、好熱アーキアAcidianusの培養条件を検討し菌体を効率良く得られる条件を見いだした後に、Acidianusの炭酸固定経路として3-ヒドロキシプロピオン酸サイクルが機能していることを、以下の実験に...

【総合生物】生体分子化学：始原菌／アーキアを含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【総合生物】神経科学：生物・生体工学／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【総合生物】実験動物学：トランスポゾン／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【農学】農芸化学：硫黄転移／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【農学】農芸化学：複合体／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【農学】農芸化学：イントロン／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【農学】農芸化学：遺伝子破壊／アーキアを含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【農学】農芸化学：原始的硫黄転移系／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【農学】農芸化学：機能未知遺伝子／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【農学】農芸化学：TCAサイクル／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【農学】農芸化学：Thermococcus ／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【農学】農芸化学：好熱性アーキア／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【農学】農芸化学：tRNAチオヌクレオチド／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【農学】農芸化学：tRNA硫黄化／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【農学】農芸化学：代謝改変／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【農学】農芸化学：水素生産／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【農学】農芸化学：モリブドプテリン／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【農学】農芸化学：ユビキチン様タンパク質／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【農学】境界農学：再構成系／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【農学】境界農学：ゲノム安定性維持／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【医歯薬学】基礎医学：鉄硫黄クラスター／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【医歯薬学】外科系臨床医学：DNA修復／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / ゲノム安定性維持 / 遺伝情報 / DNA修復 / RNAプロセシング (他12件)

【概要】超好熱アーキアから新規酵素を発見しEndoQ、EndoMSと命名した。EndoQは塩基の脱アミノ化、EndoMSはミスマッチ塩基対に対する修復酵素と予想される。これらの発見は、アーキアのDNA修復系理解のBreakthroughである。Pf-EndA、Pf-RtcB、Pf-Archaease、前駆体tRNA を用いた試験管内再構成系を構築したことで、tRNAプロセッシングの反応機構の理解が大きく進...

【医歯薬学】薬学：翻訳後修飾／アーキアを含む研究件

【キーワード】好熱性アーキア / 原始的硫黄転移系 / tRNAチオヌクレオチド / モリブドプテリン / 鉄硫黄クラスター (他10件)

【概要】超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはユビキチン様タンパク質（TK1065, TK1093, TK2118）を持つ。大腸菌などバクテリアのモリブドプテリン生合成では、ユビキチン様タンパク質のC末端GGモチーフの末端グリシンのカルボキシル基がATP依存的モリブドプテリン合成酵素アデニルイル基転移酵素によってAMP化され、その後、硫黄転移酵素によって硫黄原子が付加してca...

【医歯薬学】薬学：生化学／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【医歯薬学】薬学：プロテアーゼ／アーキアを含む研究件

【キーワード】RNA連結 / RNAリガーゼ / 超好熱性アーキア / 再構成系 / tRNA (他17件)

【概要】超好熱性アーキアであるPyrococcus furiosusをモデル生物として用い、同アーキア由来でRNA鎖の連結に関わると考えられる3種の酵素に対応する遺伝子を単離し、その組換え体タンパク質を大腸菌にて産生、精製した。これらは、我々が発現クローニング法にて見いだした(a)2'-5' RNAリガーゼ様のPF0027タンパク質。また既に報告がある酵素のホモログとして同定した(b) T...

【医歯薬学】薬学：発現制御／アーキアを含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【医歯薬学】看護学：ゲノム／アーキアを含む研究件

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【医歯薬学】看護学：メタボローム解析／アーキアを含む研究件

【キーワード】超好熱性アーキア / Thermococcus / 代謝改変 / 水素 / 微生物工学 (他11件)

【概要】絶対嫌気性超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisはデンプンやピルビン酸の酸化分解と共役したプロトン還元により水素を発生させるが、これら基質はアセチル-CoAを経て最終的に酢酸として排出される。T. kodakarensisはC6カルボン酸を変換する酵素群を有しておらず、アセチル-CoAを代謝するTCAサイクルは機能していないと考えられているが、これら酵素群を有している超...

【医歯薬学】看護学：シグナル伝達／アーキアを含む研究件

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【医歯薬学】看護学：分子生物学／アーキアを含む研究件