【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2015-05-29 - 2020-03-31

【研究代表者】金子 邦彦 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (30177513)

【キーワード】生命現象の物理 / 進化 / マクロ状態論 / １細胞計測 / ゆらぎ

【概要】理論、進化シミュレーション、および大腸菌の適応、進化実験により、細胞のみたすべき、揺らぎと応答の普遍法則を求め、定量的な生命状態論の構築を行った。具体的に、細胞の成長揺らぎと増殖の関係、増殖と死の間の法則、頑健性の帰着としての表現型の低次元拘束、適応と進化における表現型の比例変化法則などを明らかにし、さらに大腸菌の抗生物質耐性の適応、進化実験においても検証した。また機能と情報の分離に関する分子生物...

【研究テーマ】生物物理・化学物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2009 - 2012

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】生物物理 / 1細胞計測 / 幹細胞 / 適応度 / 分化応答 (他8件)

【概要】幹細胞は外部シグナルや内因的に生成される情報に基づき、さまざまな細胞タイプへ分化できる。この細胞分化がどのような論理に基づいて起こるのかを正しく理解するには、従来の幹細胞研究で用いられてきた集団計測だけでなく、個々の細胞の時間的な状態変化を実験者側から制御された環境下で調べることのできる新たな計測ツールが必要となる。本研究課題では、このような計測を実現する1細胞計測技術を開発し、それを用いてマウス...

【研究テーマ】生物物理・化学物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2009 - 2012

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】生物物理 / 1細胞計測 / 幹細胞 / 適応度 / 分化応答 (他8件)

【概要】幹細胞は外部シグナルや内因的に生成される情報に基づき、さまざまな細胞タイプへ分化できる。この細胞分化がどのような論理に基づいて起こるのかを正しく理解するには、従来の幹細胞研究で用いられてきた集団計測だけでなく、個々の細胞の時間的な状態変化を実験者側から制御された環境下で調べることのできる新たな計測ツールが必要となる。本研究課題では、このような計測を実現する1細胞計測技術を開発し、それを用いてマウス...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2015-05-29 - 2020-03-31

【研究代表者】金子 邦彦 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (30177513)

【キーワード】生命現象の物理 / 進化 / マクロ状態論 / １細胞計測 / ゆらぎ

【概要】理論、進化シミュレーション、および大腸菌の適応、進化実験により、細胞のみたすべき、揺らぎと応答の普遍法則を求め、定量的な生命状態論の構築を行った。具体的に、細胞の成長揺らぎと増殖の関係、増殖と死の間の法則、頑健性の帰着としての表現型の低次元拘束、適応と進化における表現型の比例変化法則などを明らかにし、さらに大腸菌の抗生物質耐性の適応、進化実験においても検証した。また機能と情報の分離に関する分子生物...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2018-03-31

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】1細胞計測 / 細胞情報・動態 / 成長・分裂

【概要】本研究課題では、大腸菌、分裂酵母、白血球系がん細胞を対象に、定常環境下における分裂や死の定量計測を行い、細胞生理の現象論的法則を明らかにすることを目指した。研究の結果、大腸菌では世代時間の平均と分散が線型に関係することを見出し、この関係があらゆる定常環境下での成長率の原理的上限を与える可能性を示唆した。さらに、分裂酵母の長期1細胞計測により、定常環境下での分裂率と突然死の発生率が線型に関係すること...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2018-03-31

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】1細胞計測 / 細胞情報・動態 / 成長・分裂

【概要】本研究課題では、大腸菌、分裂酵母、白血球系がん細胞を対象に、定常環境下における分裂や死の定量計測を行い、細胞生理の現象論的法則を明らかにすることを目指した。研究の結果、大腸菌では世代時間の平均と分散が線型に関係することを見出し、この関係があらゆる定常環境下での成長率の原理的上限を与える可能性を示唆した。さらに、分裂酵母の長期1細胞計測により、定常環境下での分裂率と突然死の発生率が線型に関係すること...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2015-05-29 - 2020-03-31

【研究代表者】金子 邦彦 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (30177513)

【キーワード】生命現象の物理 / 進化 / マクロ状態論 / １細胞計測 / ゆらぎ

【概要】理論、進化シミュレーション、および大腸菌の適応、進化実験により、細胞のみたすべき、揺らぎと応答の普遍法則を求め、定量的な生命状態論の構築を行った。具体的に、細胞の成長揺らぎと増殖の関係、増殖と死の間の法則、頑健性の帰着としての表現型の低次元拘束、適応と進化における表現型の比例変化法則などを明らかにし、さらに大腸菌の抗生物質耐性の適応、進化実験においても検証した。また機能と情報の分離に関する分子生物...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】生物物理・化学物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2009 - 2012

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】生物物理 / 1細胞計測 / 幹細胞 / 適応度 / 分化応答 (他8件)

【概要】幹細胞は外部シグナルや内因的に生成される情報に基づき、さまざまな細胞タイプへ分化できる。この細胞分化がどのような論理に基づいて起こるのかを正しく理解するには、従来の幹細胞研究で用いられてきた集団計測だけでなく、個々の細胞の時間的な状態変化を実験者側から制御された環境下で調べることのできる新たな計測ツールが必要となる。本研究課題では、このような計測を実現する1細胞計測技術を開発し、それを用いてマウス...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2015-05-29 - 2020-03-31

【研究代表者】金子 邦彦 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (30177513)

【キーワード】生命現象の物理 / 進化 / マクロ状態論 / １細胞計測 / ゆらぎ

【概要】理論、進化シミュレーション、および大腸菌の適応、進化実験により、細胞のみたすべき、揺らぎと応答の普遍法則を求め、定量的な生命状態論の構築を行った。具体的に、細胞の成長揺らぎと増殖の関係、増殖と死の間の法則、頑健性の帰着としての表現型の低次元拘束、適応と進化における表現型の比例変化法則などを明らかにし、さらに大腸菌の抗生物質耐性の適応、進化実験においても検証した。また機能と情報の分離に関する分子生物...

【研究テーマ】生物物理・化学物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2009 - 2012

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】生物物理 / 1細胞計測 / 幹細胞 / 適応度 / 分化応答 (他8件)

【概要】幹細胞は外部シグナルや内因的に生成される情報に基づき、さまざまな細胞タイプへ分化できる。この細胞分化がどのような論理に基づいて起こるのかを正しく理解するには、従来の幹細胞研究で用いられてきた集団計測だけでなく、個々の細胞の時間的な状態変化を実験者側から制御された環境下で調べることのできる新たな計測ツールが必要となる。本研究課題では、このような計測を実現する1細胞計測技術を開発し、それを用いてマウス...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】生物物理・化学物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2009 - 2012

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】生物物理 / 1細胞計測 / 幹細胞 / 適応度 / 分化応答 (他8件)

【概要】幹細胞は外部シグナルや内因的に生成される情報に基づき、さまざまな細胞タイプへ分化できる。この細胞分化がどのような論理に基づいて起こるのかを正しく理解するには、従来の幹細胞研究で用いられてきた集団計測だけでなく、個々の細胞の時間的な状態変化を実験者側から制御された環境下で調べることのできる新たな計測ツールが必要となる。本研究課題では、このような計測を実現する1細胞計測技術を開発し、それを用いてマウス...

【研究テーマ】生物物理・化学物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2009 - 2012

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】生物物理 / 1細胞計測 / 幹細胞 / 適応度 / 分化応答 (他8件)

【概要】幹細胞は外部シグナルや内因的に生成される情報に基づき、さまざまな細胞タイプへ分化できる。この細胞分化がどのような論理に基づいて起こるのかを正しく理解するには、従来の幹細胞研究で用いられてきた集団計測だけでなく、個々の細胞の時間的な状態変化を実験者側から制御された環境下で調べることのできる新たな計測ツールが必要となる。本研究課題では、このような計測を実現する1細胞計測技術を開発し、それを用いてマウス...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...

【研究テーマ】生物物理・化学物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2009 - 2012

【研究代表者】若本 祐一 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (30517884)

【キーワード】生物物理 / 1細胞計測 / 幹細胞 / 適応度 / 分化応答 (他8件)

【概要】幹細胞は外部シグナルや内因的に生成される情報に基づき、さまざまな細胞タイプへ分化できる。この細胞分化がどのような論理に基づいて起こるのかを正しく理解するには、従来の幹細胞研究で用いられてきた集団計測だけでなく、個々の細胞の時間的な状態変化を実験者側から制御された環境下で調べることのできる新たな計測ツールが必要となる。本研究課題では、このような計測を実現する1細胞計測技術を開発し、それを用いてマウス...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】白崎 善隆 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70469948)

【キーワード】１細胞生物学 / サイトカイン分泌 / 全反射顕微鏡 / 導波路照明 / １細胞計測 (他12件)

【概要】本研究では単一細胞レベルでの遺伝子発現の観点から免疫システムの構築・作動原理の解明に迫ることを目指した。この目的達成のために、本研究では、非侵襲的な遺伝子発現時系列解析として液性因子分泌活性を単一細胞レベルでリアルタイムに定量する方法を利用し、数百～数千個の免疫細胞からの分泌活性を秒～分オーダーの高い時間分解能で測定するシステムを開発した。研究期間内において、我々は導波路型全反射照明装置と導波路基...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】黒田 真也 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

【キーワード】時間情報コード / システム生物学 / ゾネーション / トランスオミクス / 情報理論 (他11件)

【概要】研究代表者らの1細胞レベルで情報理論の解析により、細胞間の不均一性は逆に情報として利用され組織の正確な応答制御を可能としていることが明らかとなった(1細胞レベルの情報コード)。一方、組織内では同じ細胞であっても局在に応じて異なった応答を示す(ゾネーション)。例えば、肝臓では、門脈から中心静脈へ至る順に空間的に3つの機能的ゾーンに区分けされ、門脈周囲ではグルコース合成が、中心静脈周囲では解糖系が主要...