位相幾何と超離散の融合によるシングルセルの遺伝子転写運動の解明
【研究分野】生命・健康・医療情報学
【研究キーワード】
位相幾何学 / 超離散系 / 遺伝子 / 転写 / 時空間 / ダイナミクス / シミュレーション / 時空間解析
【研究成果の概要】
細胞実験データを再現する数理モデルを構築し、細胞実験では不可能な条件における転写現象の予測を可能とする研究を行った。本研究では、このような予測シミュレーションを位相幾何学を用いることでさらに進め、様々な疾患細胞の遺伝子発現のみならず、より深く転写機構の変化にまで迫った疾患の根本的な原因究明を行った。
さらに、これまでの細胞集団の平均的な解析だけではなく、1細胞レベルでの転写の計算機シミュレーションを行うことで、シングルセル解析などにおける細胞実験との比較も行い、分化能や発現量の高い細胞特有の転写機構についても独自の解明を進めた。
【研究代表者】
【研究分担者】 |
| 井原 茂男 | 東京大学 | 先端科学技術研究センター | 特任教授 | (Kakenデータベース) |
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【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2015-04-01 - 2018-03-31
【配分額】4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)