❏tRNA使用頻度による新規翻訳調節機構の探索とメカニズムの解明(20K05954)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】長尾 翌手可 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 助教 (30588017)
【キーワード】tRNA / 翻訳 / タンパク質合成 / 遺伝暗号解読 / コドン (他6件)
【概要】前年度では翻訳中ペプチジルtRNAの抽出法を確立させたが、レポーター遺伝子のテストコドンを解読したペプチジルtRNAのみを精製する方法を確立することができなかった。そのため、今年度は一部方針を変更し、各アミノ酸のコドンを1種類に限定したレポーター遺伝子を大腸菌細胞内または無細胞翻訳系で発現させ、抽出したペプチジルtRNAのtRNA部分を配列解析することによってアイソデコーダーの使用頻度を算出する方...
❏ｍＲＮＡと新生ペプチドの局所構造による翻訳効率変化のゲノムワイド解析(24310148)
【研究テーマ】システムゲノム科学
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31
【研究代表者】中東 憲治 慶應義塾大学, 政策・メディア研究科, 特任准教授 (70322740)
【キーワード】リボソームプロファイリング / ゲノム解析技術 / リボソーム / 翻訳 / 翻訳制御 (他7件)
【概要】遺伝子mRNAからタンパク質が翻訳される状況を新しい実験手法で解析し、ゲノム全体の遺伝子を見た場合、翻訳開始の構造が翻訳の効率に大きな影響を与えることを明らかにした。対して、翻訳伸長の効率にも差はあったが、遺伝子全体の翻訳効率に大きな影響は与えていなかった。 また、コドン-アンチコドンの３文字目の認識や、small RNA/Hfqによる翻訳制御の実体など、ネイティブな翻訳関連因子の性質についてや、...
❏繊毛虫の多様性を利用した翻訳終結因子の終止コドン認識機構の解析(22570170)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2010 - 2012
【研究代表者】春本 晃江 奈良女子大学, 自然科学系, 教授 (80198936)
【キーワード】タンパク質合成 / 遺伝暗号 / 原生生物 / 翻訳終結因子 / 翻訳 (他8件)
【概要】繊毛虫類の終止コドン認識に関わるアミノ酸残基を同定することを目的とし、3つの終止コドンを認識するDileptusmargaritiferと変則的な終止コドン認識を行うEuplotesraikoviのeRF1の特定のアミノ酸残基を変異させ、酵母の系で認識能力を調べることにより、終止コドン認識に関わるアミノ酸残基を同定することを目指した。K25、R128、H134について調べたところ、eRF1ドメイン...