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エピジェネテイクスに関するサイレントキーワード転写が含まれる科研費採択研究5件

エピジェネテイクスに関するサイレントキーワード転写が含まれる科研費採択研究 5件

転写量低下に伴うヌクレオソーム凝集を調節するヒストン修飾の網羅的同定
【研究領域課題番号】22K06185 (KAKENデータベースで見る）
【研究キーワード】

クロマチン / ヌクレオソーム / ヒストン / 転写 / エピジェネティクス
【研究代表者】

石原悟藤田医科大学医学部講師 (Kakenデータベース)
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2022-04-01 - 2025-03-31
【配分額】4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)

【研究分担者】
川村猛東京大学アイソトープ総合センター准教授 (Kakenデータベース)

胚性ゲノム活性化に伴うヒストン修飾動態のin vivoイメージング
【研究分野】遺伝・染色体動態
【研究領域課題番号】15K07157 (KAKENデータベースで見る）
【研究キーワード】

エピジェネティクス / 胚性ゲノム活性化 / ライブイメージング / 転写 / ヒストン修飾 / ゼブラフィッシュ
【研究成果の概要】

ゼブラフィッシュ卵に蛍光標識した活性型RNAポリメラーゼII特異的Fabを注入しライブ観察を行うことで、胚ゲノム活性化を観察し計測することに成功した。同様にヒストン修飾特異的Fabを導入することで、H3K27acが転写活性化の前に上昇することがわかった。また、胚性ゲノム活性化に先立って発現が亢進するmiR-430クラスターにおいて、H3K27acが転写よりも先に上昇することも明らかにした。アセチル化ヒストン結合タンパク質の阻害剤を添加することで活性型RNAポリメラーゼIIの集積が見られなくなることから、H3K27acが胚性ゲノム活性化に重要な役割を果たしていることが示唆された。
【研究の社会的意義】

これまで生きた胚の中で発生過程におけるヒストン修飾レベルを調べる方法はなかった。今回初めて転写活性化とヒストン修飾動態を同時に観察することに成功した。本研究で開発した方法は、今後個体レベルでのクロマチン動態研究に貢献することが期待できる。
【研究代表者】

佐藤優子東京工業大学科学技術創成研究院助教 (Kakenデータベース)
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2015-04-01 - 2019-03-31
【配分額】5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)

遺伝子転写領域におけるＤＮＡメチル化の役割と制御機構の解析
【研究分野】遺伝・ゲノム動態
【研究領域課題番号】24770009 (KAKENデータベースで見る）
【研究キーワード】

エピジェネティクス / DNAメチル化 / 転写 / DNA複製 / DNA傷害
【研究成果の概要】

本研究は、モデル生物シロイヌナズナを用いて、分子生物学的および情報学的な手法により、転写活性化状態にある遺伝子転写領域上のDNAメチル化がもつ生物学的機能の探索を試みた。その結果、遺伝子転写領域のDNAメチル化がDNA複製期におけるねじれストレスおよびDNA傷害に対し抑制的にはたらく可能性が示唆された。また、変異体スクリーニング解析により、遺伝子転写領域上のDNAメチル化が減少する変異体の単離に成功した。本研究の成果は、遺伝子転写領域上のDNAメチル化と、DNA複製やDNA傷害との関連性を示唆する新たな視点を提唱し、また遺伝子転写領域上のDNAメチル化を研究する新たな材料を提供する。
【研究代表者】

藤泰子国立遺伝学研究所総合遺伝研究系特任研究員 (Kakenデータベース)
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31
【配分額】4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)

スプライシング因子の新機能に関する化学遺伝学研究

【研究分野】応用生物化学

【研究領域課題番号】21228003 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

スプライシング / イントロン / 転写 / 核-細胞質間輸送 / 非コードRNA / エピジェネティクス / 転写終結 / マイクロRNA

【研究成果の概要】

Spliceostatin A（SSA）は抗がん抗生物質FR901464 の化学的に安定な誘導体であり、研究代表者らはSSAがスプライシング因子SF3bに特異的に結合する世界初のスプライシング阻害剤であることを明らかにしてきた。SSAを用いることでスプライシング因子やイントロンの新しい機能の同定につながると考えられる。そこで本研究はSSAによって引き起こされる多様な表現型の作用機構を解析し、スプライシング因子の未知の役割の解明を目指した。その結果、pre-mRNA核内保持、転写伸長、ポリA付加、核内非コードRNAの局在制御にスプライシング因子が関与することを明らかにした。

【研究代表者】

吉田稔独立行政法人理化学研究所吉田化学遺伝学研究室主任研究員 (Kakenデータベース)

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2009-05-11 - 2014-03-31

【配分額】199,810千円 (直接経費: 153,700千円、間接経費: 46,110千円)

【研究分担者】
中川真一	独立行政法人理化学研究所	中川RNA生物学研究室	准主任研究員	(Kakenデータベース)

【研究連携者】
古米亮平	独立行政法人理化学研究所	基幹研究所	基礎科学特別研究員	(Kakenデータベース)

M26/CRE配列におけるクロマチン再編成とストレス応答

【研究分野】遺伝・ゲノム動態

【研究領域課題番号】19570008 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

クロマチン / ヒストン修飾 / 後生遺伝学 / ストレス応答 / ノンコーディングRNA / エピゲノム / ヒストン / 組換え / 転写 / 減数分裂 / 転写制御 / 染色体 / non-coding RNA / エピジェネティクス

【研究成果の概要】

分裂酵母M26/CRE 配列の周辺におけるヒストン修飾やクロマチン再編成に関わる因子を数種同定し、それらの欠失変異株について、種々のストレスに対する感受性やヒストン修飾における役割を解明した。さらに、グルコース飢餓時に転写が活性化する分裂酵母fbp1+遺伝子座におけるクロマチン再編成に、mRNA 型の長鎖ノンコーディングRNA のカスケード転写が関わることを見出し、ノンコーディングRNA を介した新しい転写活性化モデルを提出した。

【研究代表者】

太田邦史東京大学大学院・総合文化研究科教授 (Kakenデータベース)

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2007 - 2008

【配分額】4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)

【研究分担者】
廣田耕志	独立行政法人理化学研究所	基礎科学特別研究員	(Kakenデータベース)

【研究連携者】
廣田耕志	京都大学	大学院・医学系研究科	助教	(Kakenデータベース)
山田貴富	東京大学	大学院・総合文化研究科	助教	(Kakenデータベース)

【研究分担者】
川村猛	東京大学	アイソトープ総合センター	准教授	(Kakenデータベース)