転写ファクトリーの熱力学と情報処理の研究
【研究分野】システムゲノム科学
【研究キーワード】
モデル化 / シミュレーション / 転写過程 / 散逸構造 / ゲノム科学
【研究成果の概要】
真核生物における転写過程において、転写を担うポリメレース(RNAPII)の流れをセルオートマトンで定式化し、流れの動的、熱力学的性質を調べた。その結果、RNAPIIのTSSへの入射のタイミングで表されるRNAPIIの相関、RNAPIIの領域毎の速度差で表されるクロマチン修飾等の経路の途中の障害物の大きさ、さらにはRNAPIIのジャンプ確率で表されるクロマチンのループの3次元空間位置に依存して、転写ファクトリーにおけるRNAPIIの流れの動的、熱力学的性質が大きく変化することをみいだした。
【研究代表者】
【研究分担者】 |
| 大田 佳宏 | 東京大学 | 先端科学技術研究センター | 特任助教 | (Kakenデータベース) |
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【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2011 - 2012
【配分額】3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)