次世代シーケンシングによるメダカ小分子RNAの完全解析と機能の解明
【研究分野】基礎ゲノム科学
【研究キーワード】
動物ゲノム / メダカ / トラフグ / 次世代シーケンサー / 小分子RNA / マイクロRNA / piRNA / トランスクリプトーム / miRNA / 遺伝子発現 / 魚類 / 発現フロフィール / 新規RNA
【研究成果の概要】
本研究では次世代シーケンサーを用いてメダカおよびトラフグの各組織(速筋、遅筋、腸、眼、脳、心臓、肝臓、卵巣、精巣、初期胚など)から得た小分子RNA(miRNA, piRNA, siRNA)の塩基配列を解読し、その発現プロフィールを明らかにした。精巣、卵巣以外の各組織ではmiRNAが主要な発現産物であったが、精巣、卵巣ではpiRNAが主要な発現産物であることが推定された。またメダカとトラフグに共通に発現している未同定の小分子RNAを多数見いだした
【研究代表者】