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大腸菌Saga
大腸菌
に関するサイレントキーワード
ゲノム進化・再編
が含まれる科研費採択研究1件
大腸菌
に関するサイレントキーワード
ゲノム進化・再編
が含まれる科研費採択研究 1件
ChIP-chipによる3種の
大腸菌
を用いた転写因子結合部位の多様性の解析
【研究分野】基礎ゲノム科学
【研究領域課題番号】
20241045 (KAKENデータベースで見る)
【研究キーワード】
ゲノム進化・再編
/ ChIP-chip / 転写制御ネットワーク / ChAP-chip / Fur / H-NS / Zur / 転写ネットワーク /
大腸菌
/ 病原性
大腸菌
/ 転写制御システム / ChIP-chip解析 / ChIP-seq解析
【研究成果の概要】
ChIP-chipおよびChAP-seqを用いて、複数の
大腸菌
種におけるグローバルレギュレーターの結合領域を比較することで、
大腸菌
のゲノム多様性の獲得と転写ネットワークの変化がどのように関係するかを検討した。その結果、今回検討した転写因子では、
大腸菌
株間における結合プロファイルの保存性が極めて高く、転写因子が制御する遺伝子に変異が生じた場合でも、その結合プロファイルは維持されることが示唆された。
【研究代表者】
小笠原 直毅 奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 教授
(Kakenデータベース)
【研究分担者】
大島 拓
奈良先端科学技術大学院大学
情報科学究科
助教
(Kakenデータベース)
黒川 顕
東京工業大学
生命理工学研究科
教授
(Kakenデータベース)
戸邉 亨
大阪大学
大学院・医学研究科
准教授
(Kakenデータベース)
鈴木 穣 (鈴木 譲)
東京大学
大学院・新領域創成科学研究科
准教授
(Kakenデータベース)
【研究連携者】
饗場 浩文
名古屋大学
生命農学研究科
准教授
(Kakenデータベース)
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2008 - 2010
【配分額】50,440千円 (直接経費: 38,800千円、間接経費: 11,640千円)