HIV薬剤耐性検査のためのパイロジェノタイピング手法の開発
【研究分野】生物機能・バイオプロセス
【研究キーワード】
pyrosequencing / HIV / quasispecies / 同時並列個別増幅 / 一分子計測 / パイロシークエンス / ゲノム / 多様性解析 / シングルセル解析
【研究成果の概要】
HIV内での多様な変異を効率的に検出するパイロシークエンスを基盤とした一分子解析手法の確立とHIVのquasispecies形成の機構解明をシークエンスによって検討した。結果、10コピー以下のcDNA分子の個別増幅が可能なシステム構築が達成でき、かつquasispecies形成を解析する基礎となるプロウイルスDNAのサブタイプ分類やGag、PRが共進化を辿っていることを示すことができた。
【研究代表者】