機能エレメントと深層学習に基づく長鎖ノンコーディングRNAの機能分類
【研究分野】生命・健康・医療情報学
【研究キーワード】
lncRNA / ノンコーディングRNA / RNA修飾 / RNA構造 / リピート要素 / 深層学習 / 長鎖ノンコーディングRNA / 機能エレメント / RNA結合タンパク質 / RNA相互作用 / バイオインフォマティクス / トランスポゾン / 機能推定 / lncRNA-RNA相互作用 / リボソーム / 機械学習 / m6A / 大規模実験情報 / 進化
【研究成果の概要】
タンパク質に翻訳されずにRNA自体が機能を有する長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA）の機能を明らかにするために，RNAの配列・構造・修飾・生体高分子との相互作用などの「機能エレメント」に着目し情報学的な観点から多くの研究を行った．例えば，ジャンクだと考えられていたリピート配列がlncRNAの組織特異的な発現に寄与していたり，タンパク質やDNAとの相互作用に寄与していることを明らかにすることによりlncRNAの機能の解明を試みた．これらを通してlncRNAの機能の分類に寄与する情報基盤技術を確立し，広く公開を行った．
【研究代表者】
【研究種目】若手研究(A)
【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31
【配分額】23,400千円 (直接経費: 18,000千円、間接経費: 5,400千円)