【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(長崎), 主任研究員 (00583147)

【キーワード】褐虫藻 / サンゴ礁生態系 / 食物網ルート / 海洋生態 / 生物圏現象

【概要】サンゴから放出された褐虫藻がサンゴ礁の動物プランクトンに直接捕食される食物網ルートはないだろうか。褐虫藻の持つ特徴的な化合物をマーカーにして、動物プランクトンが褐虫藻を捕食した痕跡を探ることを考えた。様々な褐虫藻培養株の持つ代謝物を分析し、サンゴから単離したSymbiodinium microadriaticumの培養株が持つホモトリゴネリンをマーカー候補物質とした。サンゴの多い場所とサンゴ礁の沖...

【研究テーマ】生態・環境

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 西海区水産研究所, 研究員 (00583147)

【キーワード】サンゴ礁生態系 / 海洋生態 / 生物圏現象 / 共生生物学 / 海洋保全 (他8件)

【概要】室内実験の結果，遺伝子型A1とA3の褐虫藻はAcropora tenuis幼生との共生が成立したが，遺伝子型A2の褐虫藻は幼生から排出された。幼生の着生や生残に褐虫藻の遺伝子型や褐虫藻の有無は影響しなかった。野外実験では，A1とA2の褐虫藻を取り込ませた幼生を野外の格子状基盤に着生させたが，その後の観察によりA2の褐虫藻は速やかに排出され，新たに環境中から取り込んだと思われるA1やDの褐虫藻に入れ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2021-04-05 - 2025-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(長崎), 主任研究員 (00583147)

【キーワード】共生体 / 褐虫藻 / サンゴ / シャコガイ / サンゴ礁

【概要】海の熱帯雨林とも称されるサンゴ礁では、刺胞動物のサンゴや二枚貝のシャコガイが褐虫藻と呼ばれる微細な藻類と共生して繁栄している。本研究では、観察により得られた「現象」に関与する「物質」の詳細を明らかにし、それら物質の共生体内での「局在・分布・遷移」を可視化することで、生命現象が複雑に絡み合う褐虫藻共生システムを体系的に理解することを目的とする。令和3年度は主にシャコガイ類を用いて実験を実施した。シャ...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】新里 宙也 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / 白化現象 / 遺伝子発現応答

【概要】サンゴと褐虫藻の共生システムの分子メカニズムを、次世代シークエンサーを用いて網羅的・ゲノム科学的に明らかにすることを目的とする。トランスクリプトームとゲノムの情報を用いて、サンゴ(コユビミドリイシAcropora digitifera)の全遺伝子を網羅したcDNAマイクロアレイを作成し、ストレス下での遺伝子発現変化を解析した。さらにサンゴのゲノム情報から、ストレス応答に関わっているとされる遺伝子に...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】新里 宙也 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / 白化現象 / 遺伝子発現応答

【概要】サンゴと褐虫藻の共生システムの分子メカニズムを、次世代シークエンサーを用いて網羅的・ゲノム科学的に明らかにすることを目的とする。トランスクリプトームとゲノムの情報を用いて、サンゴ(コユビミドリイシAcropora digitifera)の全遺伝子を網羅したcDNAマイクロアレイを作成し、ストレス下での遺伝子発現変化を解析した。さらにサンゴのゲノム情報から、ストレス応答に関わっているとされる遺伝子に...

【研究テーマ】生態・環境

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 西海区水産研究所, 研究員 (00583147)

【キーワード】サンゴ礁生態系 / 海洋生態 / 生物圏現象 / 共生生物学 / 海洋保全 (他8件)

【概要】室内実験の結果，遺伝子型A1とA3の褐虫藻はAcropora tenuis幼生との共生が成立したが，遺伝子型A2の褐虫藻は幼生から排出された。幼生の着生や生残に褐虫藻の遺伝子型や褐虫藻の有無は影響しなかった。野外実験では，A1とA2の褐虫藻を取り込ませた幼生を野外の格子状基盤に着生させたが，その後の観察によりA2の褐虫藻は速やかに排出され，新たに環境中から取り込んだと思われるA1やDの褐虫藻に入れ...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(長崎), 主任研究員 (00583147)

【キーワード】褐虫藻 / サンゴ礁生態系 / 食物網ルート / 海洋生態 / 生物圏現象

【概要】サンゴから放出された褐虫藻がサンゴ礁の動物プランクトンに直接捕食される食物網ルートはないだろうか。褐虫藻の持つ特徴的な化合物をマーカーにして、動物プランクトンが褐虫藻を捕食した痕跡を探ることを考えた。様々な褐虫藻培養株の持つ代謝物を分析し、サンゴから単離したSymbiodinium microadriaticumの培養株が持つホモトリゴネリンをマーカー候補物質とした。サンゴの多い場所とサンゴ礁の沖...

【研究テーマ】生態・環境

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 西海区水産研究所, 研究員 (00583147)

【キーワード】サンゴ礁生態系 / 海洋生態 / 生物圏現象 / 共生生物学 / 海洋保全 (他8件)

【概要】室内実験の結果，遺伝子型A1とA3の褐虫藻はAcropora tenuis幼生との共生が成立したが，遺伝子型A2の褐虫藻は幼生から排出された。幼生の着生や生残に褐虫藻の遺伝子型や褐虫藻の有無は影響しなかった。野外実験では，A1とA2の褐虫藻を取り込ませた幼生を野外の格子状基盤に着生させたが，その後の観察によりA2の褐虫藻は速やかに排出され，新たに環境中から取り込んだと思われるA1やDの褐虫藻に入れ...

【研究テーマ】生態・環境

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 西海区水産研究所, 研究員 (00583147)

【キーワード】サンゴ礁生態系 / 海洋生態 / 生物圏現象 / 共生生物学 / 海洋保全 (他8件)

【概要】室内実験の結果，遺伝子型A1とA3の褐虫藻はAcropora tenuis幼生との共生が成立したが，遺伝子型A2の褐虫藻は幼生から排出された。幼生の着生や生残に褐虫藻の遺伝子型や褐虫藻の有無は影響しなかった。野外実験では，A1とA2の褐虫藻を取り込ませた幼生を野外の格子状基盤に着生させたが，その後の観察によりA2の褐虫藻は速やかに排出され，新たに環境中から取り込んだと思われるA1やDの褐虫藻に入れ...

【研究テーマ】生態・環境

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 西海区水産研究所, 研究員 (00583147)

【キーワード】サンゴ礁生態系 / 海洋生態 / 生物圏現象 / 共生生物学 / 海洋保全 (他8件)

【概要】室内実験の結果，遺伝子型A1とA3の褐虫藻はAcropora tenuis幼生との共生が成立したが，遺伝子型A2の褐虫藻は幼生から排出された。幼生の着生や生残に褐虫藻の遺伝子型や褐虫藻の有無は影響しなかった。野外実験では，A1とA2の褐虫藻を取り込ませた幼生を野外の格子状基盤に着生させたが，その後の観察によりA2の褐虫藻は速やかに排出され，新たに環境中から取り込んだと思われるA1やDの褐虫藻に入れ...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2021-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】高木 俊幸 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (00814526)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / ホロビオント / カロテノイド生産菌 / ゼアキサンチン (他9件)

【概要】本研究では褐虫藻-カロテノイド生産菌を中心にサンゴホロビオントにおける生物間相互作用をマルチオミクス解析により明らかにし、カロテノイド生産菌が褐虫藻のROS産生を軽減する機構を全容解明する。本年度は、まずサンゴと共生する主要な褐虫藻であるCladocopiumおよびDurusdiniumの継続的な培養を開始し、カロテノイド生産菌の分離培養を試みた。Cladocopiumからはオレンジ色を呈するコロ...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2021-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】高木 俊幸 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (00814526)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / ホロビオント / カロテノイド生産菌 / ゼアキサンチン (他9件)

【概要】本研究では褐虫藻-カロテノイド生産菌を中心にサンゴホロビオントにおける生物間相互作用をマルチオミクス解析により明らかにし、カロテノイド生産菌が褐虫藻のROS産生を軽減する機構を全容解明する。本年度は、まずサンゴと共生する主要な褐虫藻であるCladocopiumおよびDurusdiniumの継続的な培養を開始し、カロテノイド生産菌の分離培養を試みた。Cladocopiumからはオレンジ色を呈するコロ...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2021-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】高木 俊幸 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (00814526)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / ホロビオント / カロテノイド生産菌 / ゼアキサンチン (他9件)

【概要】本研究では褐虫藻-カロテノイド生産菌を中心にサンゴホロビオントにおける生物間相互作用をマルチオミクス解析により明らかにし、カロテノイド生産菌が褐虫藻のROS産生を軽減する機構を全容解明する。本年度は、まずサンゴと共生する主要な褐虫藻であるCladocopiumおよびDurusdiniumの継続的な培養を開始し、カロテノイド生産菌の分離培養を試みた。Cladocopiumからはオレンジ色を呈するコロ...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2021-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】高木 俊幸 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (00814526)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / ホロビオント / カロテノイド生産菌 / ゼアキサンチン (他9件)

【概要】本研究では褐虫藻-カロテノイド生産菌を中心にサンゴホロビオントにおける生物間相互作用をマルチオミクス解析により明らかにし、カロテノイド生産菌が褐虫藻のROS産生を軽減する機構を全容解明する。本年度は、まずサンゴと共生する主要な褐虫藻であるCladocopiumおよびDurusdiniumの継続的な培養を開始し、カロテノイド生産菌の分離培養を試みた。Cladocopiumからはオレンジ色を呈するコロ...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2021-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】高木 俊幸 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (00814526)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / ホロビオント / カロテノイド生産菌 / ゼアキサンチン (他9件)

【概要】本研究では褐虫藻-カロテノイド生産菌を中心にサンゴホロビオントにおける生物間相互作用をマルチオミクス解析により明らかにし、カロテノイド生産菌が褐虫藻のROS産生を軽減する機構を全容解明する。本年度は、まずサンゴと共生する主要な褐虫藻であるCladocopiumおよびDurusdiniumの継続的な培養を開始し、カロテノイド生産菌の分離培養を試みた。Cladocopiumからはオレンジ色を呈するコロ...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2021-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】高木 俊幸 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (00814526)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / ホロビオント / カロテノイド生産菌 / ゼアキサンチン (他9件)

【概要】本研究では褐虫藻-カロテノイド生産菌を中心にサンゴホロビオントにおける生物間相互作用をマルチオミクス解析により明らかにし、カロテノイド生産菌が褐虫藻のROS産生を軽減する機構を全容解明する。本年度は、まずサンゴと共生する主要な褐虫藻であるCladocopiumおよびDurusdiniumの継続的な培養を開始し、カロテノイド生産菌の分離培養を試みた。Cladocopiumからはオレンジ色を呈するコロ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】新里 宙也 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / ゲノム

【概要】サンゴ礁を形成する造礁サンゴは、細胞内の共生藻類、褐虫藻と密接な相利共生関係を築いている。しかし温暖化などの地球規模の環境変動により、サンゴと褐虫藻の共生関係の崩壊、白化現象が頻発しており、世界中でサンゴ礁が減少を続けている。一方でサンゴ礁の基盤となるサンゴ-褐虫藻の共生メカニズムやその成立・維持の分子機構は、未だ多くが謎のままである。本研究はゲノム科学的手法を駆使し、現在進行系の環境変動の影響を...

【研究テーマ】構成的システム生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2017-07-18 - 2021-03-31

【研究代表者】新里 宙也 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / ゲノム / 遺伝子

【概要】サンゴは、宿主動物の造礁サンゴと共生している藻類が共生し、あたかも一つの生物、ホロビオントとして生存する。本研究では、サンゴと褐虫藻のゲノム情報を活用し、複雑なサンゴ“ホロビオント”構成原理の解明に挑んだ。サンゴ幼生への褐虫藻培養株の感染実験と網羅的遺伝子発現解析により、共生に関わるサンゴの遺伝子群を特定した。これらの機能推定や進化的背景が明らかになり、多様なサンゴの共生メカニズムの存在が示唆され...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2021-04-05 - 2025-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(長崎), 主任研究員 (00583147)

【キーワード】共生体 / 褐虫藻 / サンゴ / シャコガイ / サンゴ礁

【概要】海の熱帯雨林とも称されるサンゴ礁では、刺胞動物のサンゴや二枚貝のシャコガイが褐虫藻と呼ばれる微細な藻類と共生して繁栄している。本研究では、観察により得られた「現象」に関与する「物質」の詳細を明らかにし、それら物質の共生体内での「局在・分布・遷移」を可視化することで、生命現象が複雑に絡み合う褐虫藻共生システムを体系的に理解することを目的とする。令和3年度は主にシャコガイ類を用いて実験を実施した。シャ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(長崎), 主任研究員 (00583147)

【キーワード】褐虫藻 / サンゴ礁生態系 / 食物網ルート / 海洋生態 / 生物圏現象

【概要】サンゴから放出された褐虫藻がサンゴ礁の動物プランクトンに直接捕食される食物網ルートはないだろうか。褐虫藻の持つ特徴的な化合物をマーカーにして、動物プランクトンが褐虫藻を捕食した痕跡を探ることを考えた。様々な褐虫藻培養株の持つ代謝物を分析し、サンゴから単離したSymbiodinium microadriaticumの培養株が持つホモトリゴネリンをマーカー候補物質とした。サンゴの多い場所とサンゴ礁の沖...

【研究テーマ】生態・環境

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 西海区水産研究所, 研究員 (00583147)

【キーワード】サンゴ礁生態系 / 海洋生態 / 生物圏現象 / 共生生物学 / 海洋保全 (他8件)

【概要】室内実験の結果，遺伝子型A1とA3の褐虫藻はAcropora tenuis幼生との共生が成立したが，遺伝子型A2の褐虫藻は幼生から排出された。幼生の着生や生残に褐虫藻の遺伝子型や褐虫藻の有無は影響しなかった。野外実験では，A1とA2の褐虫藻を取り込ませた幼生を野外の格子状基盤に着生させたが，その後の観察によりA2の褐虫藻は速やかに排出され，新たに環境中から取り込んだと思われるA1やDの褐虫藻に入れ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水研機構(長崎), 主任研究員 (00583147)

【キーワード】褐虫藻 / サンゴ礁生態系 / 食物網ルート / 海洋生態 / 生物圏現象

【概要】サンゴから放出された褐虫藻がサンゴ礁の動物プランクトンに直接捕食される食物網ルートはないだろうか。褐虫藻の持つ特徴的な化合物をマーカーにして、動物プランクトンが褐虫藻を捕食した痕跡を探ることを考えた。様々な褐虫藻培養株の持つ代謝物を分析し、サンゴから単離したSymbiodinium microadriaticumの培養株が持つホモトリゴネリンをマーカー候補物質とした。サンゴの多い場所とサンゴ礁の沖...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】水圏生命科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】新里 宙也 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 環境DNA / 褐虫藻 / ゲノム

【概要】気候変動などの影響によりサンゴ礁の状況は刻々と深刻化しており、そのきめ細かいモニタリングは重要である。本研究は、海水中に存在する環境DNAに注目し、海水を汲むだけでサンゴの検出を可能にする、新たなモニタリング手法の開発を目指した。サンゴと共生藻類を海水から検出できるのか確認するために水槽実験を行った結果、海水中の環境DNAは近傍に存在するサンゴの状況を良く反映していることが明らかになった。 ...

【研究テーマ】2020

【研究種目】サンゴ

【研究期間】褐虫藻

【研究代表者】共生

【キーワード】ゲノム

【概要】海の熱帯雨林とも称されるサンゴ礁では、刺胞動物のサンゴや二枚貝のシャコガイが褐虫藻と呼ばれる微細な藻類と共生して繁栄している。本研究では、観察により得られた「現象」に関与する「物質」の詳細を明らかにし、それら物質の共生体内での「局在・分布・遷移」を可視化することで、生命現象が複雑に絡み合う褐虫藻共生システムを体系的に理解することを目的とする。令和3年度は主にシャコガイ類を用いて実験を実施した。シャ...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2021-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】高木 俊幸 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (00814526)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / ホロビオント / カロテノイド生産菌 / ゼアキサンチン (他9件)

【概要】本研究では褐虫藻-カロテノイド生産菌を中心にサンゴホロビオントにおける生物間相互作用をマルチオミクス解析により明らかにし、カロテノイド生産菌が褐虫藻のROS産生を軽減する機構を全容解明する。本年度は、まずサンゴと共生する主要な褐虫藻であるCladocopiumおよびDurusdiniumの継続的な培養を開始し、カロテノイド生産菌の分離培養を試みた。Cladocopiumからはオレンジ色を呈するコロ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】新里 宙也 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / ゲノム

【概要】サンゴ礁を形成する造礁サンゴは、細胞内の共生藻類、褐虫藻と密接な相利共生関係を築いている。しかし温暖化などの地球規模の環境変動により、サンゴと褐虫藻の共生関係の崩壊、白化現象が頻発しており、世界中でサンゴ礁が減少を続けている。一方でサンゴ礁の基盤となるサンゴ-褐虫藻の共生メカニズムやその成立・維持の分子機構は、未だ多くが謎のままである。本研究はゲノム科学的手法を駆使し、現在進行系の環境変動の影響を...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2021-04-05 - 2025-03-31

【研究代表者】山下 洋 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(長崎), 主任研究員 (00583147)

【キーワード】共生体 / 褐虫藻 / サンゴ / シャコガイ / サンゴ礁

【概要】海の熱帯雨林とも称されるサンゴ礁では、刺胞動物のサンゴや二枚貝のシャコガイが褐虫藻と呼ばれる微細な藻類と共生して繁栄している。本研究では、観察により得られた「現象」に関与する「物質」の詳細を明らかにし、それら物質の共生体内での「局在・分布・遷移」を可視化することで、生命現象が複雑に絡み合う褐虫藻共生システムを体系的に理解することを目的とする。令和3年度は主にシャコガイ類を用いて実験を実施した。シャ...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2021-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】高木 俊幸 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (00814526)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / ホロビオント / カロテノイド生産菌 / ゼアキサンチン (他9件)

【概要】本研究では褐虫藻-カロテノイド生産菌を中心にサンゴホロビオントにおける生物間相互作用をマルチオミクス解析により明らかにし、カロテノイド生産菌が褐虫藻のROS産生を軽減する機構を全容解明する。本年度は、まずサンゴと共生する主要な褐虫藻であるCladocopiumおよびDurusdiniumの継続的な培養を開始し、カロテノイド生産菌の分離培養を試みた。Cladocopiumからはオレンジ色を呈するコロ...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】遺伝・染色体動態

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (90378563)

【キーワード】渦鞭毛藻 / サンゴ / 紫外線吸収物質 / 褐虫藻 / ゲノム (他16件)

【概要】サンゴに共生する渦鞭毛藻類の褐虫藻Symbiodiniaceaeは、少なくとも15のグループに分けることができるが、そのゲノム多様性やエピゲノムに関する研究は進んでいない。本研究では褐虫藻2種の全ゲノム配列（767 Mbと705 Mb）を決定した。比較解析により、二次共生により紅藻から獲得したと考えられる遺伝子の重複や損失が褐虫藻の多様化に影響してきたことを明らかにした。解読した褐虫藻ゲノムを利用...

【研究テーマ】構成的システム生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2017-07-18 - 2021-03-31

【研究代表者】新里 宙也 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / ゲノム / 遺伝子

【概要】サンゴは、宿主動物の造礁サンゴと共生している藻類が共生し、あたかも一つの生物、ホロビオントとして生存する。本研究では、サンゴと褐虫藻のゲノム情報を活用し、複雑なサンゴ“ホロビオント”構成原理の解明に挑んだ。サンゴ幼生への褐虫藻培養株の感染実験と網羅的遺伝子発現解析により、共生に関わるサンゴの遺伝子群を特定した。これらの機能推定や進化的背景が明らかになり、多様なサンゴの共生メカニズムの存在が示唆され...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】新里 宙也 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / ゲノム

【概要】サンゴ礁を形成する造礁サンゴは、細胞内の共生藻類、褐虫藻と密接な相利共生関係を築いている。しかし温暖化などの地球規模の環境変動により、サンゴと褐虫藻の共生関係の崩壊、白化現象が頻発しており、世界中でサンゴ礁が減少を続けている。一方でサンゴ礁の基盤となるサンゴ-褐虫藻の共生メカニズムやその成立・維持の分子機構は、未だ多くが謎のままである。本研究はゲノム科学的手法を駆使し、現在進行系の環境変動の影響を...

【研究テーマ】水圏生命科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】新里 宙也 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 環境DNA / 褐虫藻 / ゲノム

【概要】気候変動などの影響によりサンゴ礁の状況は刻々と深刻化しており、そのきめ細かいモニタリングは重要である。本研究は、海水中に存在する環境DNAに注目し、海水を汲むだけでサンゴの検出を可能にする、新たなモニタリング手法の開発を目指した。サンゴと共生藻類を海水から検出できるのか確認するために水槽実験を行った結果、海水中の環境DNAは近傍に存在するサンゴの状況を良く反映していることが明らかになった。 ...

【研究テーマ】構成的システム生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2017-07-18 - 2021-03-31

【研究代表者】新里 宙也 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

【キーワード】サンゴ / 褐虫藻 / 共生 / ゲノム / 遺伝子

【概要】サンゴは、宿主動物の造礁サンゴと共生している藻類が共生し、あたかも一つの生物、ホロビオントとして生存する。本研究では、サンゴと褐虫藻のゲノム情報を活用し、複雑なサンゴ“ホロビオント”構成原理の解明に挑んだ。サンゴ幼生への褐虫藻培養株の感染実験と網羅的遺伝子発現解析により、共生に関わるサンゴの遺伝子群を特定した。これらの機能推定や進化的背景が明らかになり、多様なサンゴの共生メカニズムの存在が示唆され...