[Discovery Saga Top] [Saga Next] [無料公開版Discovery Saga] [Discovery Sagaプレミアムご案内] [早稲田大学研究Discovery Saga] [産学連携のご案内] [Saga Concept] [会社概要] [お問い合わせ]
キーワード  ヌクレオソーム が関係する  研究 Discovery Saga
Saga Wall 表示 関係研究分野、サイレントキーワード Wall 内の項目をマウスオーバーで研究を絞り込み、マウスクリックで確定することができます。　　パネル表示に切り替え　　Saga検索初期化
研究分野別サイレントキーワード
「ヌクレオソーム」とサイレントキーワードを含む研究
【生物学】生物学：ベントDNA(bent DNA) ／ヌクレオソームを含む研究件
❏転写開始のためのクロマチン基盤構造の構築機構:ベントDNAが担う役割の解明(15570147)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2003 - 2004
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理工学部, 教授 (60268513)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写調節 (他9件)
【概要】代表的な二つの研究成果について述べる。 (1)真核生物遺伝子のプロモーターデータベースである"EPD(eukaryotic promoter database)"に公開されているヒトのプロモーターのすべて(1871種)を対象として、DNAのフレキシビリティーを解析した。その結果、TATAボックスもイニシエーターも共に上流側が"柔らかい"配列で構成され、下流側は...
❏転写の開始段階に必須なクロマチン構造の実体解明(13680770)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2001 - 2002
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理工学部, 教授 (60268513)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写調節 (他6件)
【概要】本研究では、まず、一過的に導入されたレポーター上に細胞核内で形成されるクロマチン構造を解析した。レポーターには、負の超らせんを擬態した176bpの人工ベントDNA(T20)をもつ単純ヘルペスウィルスtkプロモーター、T20をもつヒトhsp70Bプロモーター、ならびに左方向に緩やかにねじれた構造をとったマウスpgk-1プロモーターを用いた。T20は、我々が構築したベントDNAであり、細胞内でtkプロ...
❏真核細胞プロモーターにおけるベントDNAの機能発現メカニズムの解析(09680681)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】1997 - 1998
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理学部, 助教授 (60268513)
【キーワード】ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写制御 / クロマチン / ヌクレオソーム (他8件)
【概要】本研究では、人工合成したベントDNAとヘルペス単純ウイルスのチミジンキナーゼ(tk)プロモーターまたはヒトアデノウイルス2型E1A遺伝子プロモーターを用いて、50種類にものぼる組換え体を作製し、ベントDNAの形、プロモーターに対する回転上の配向、そしてその存在位置がプロモーターの活性に与える影響について、系統的な解析を行った。その結果、プロモーターを活性化できるベントDNAの形を解明し、加えて、プ...
【生物学】生物学：DNA高次構造 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏転写開始のためのクロマチン基盤構造の構築機構:ベントDNAが担う役割の解明(15570147)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2003 - 2004
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理工学部, 教授 (60268513)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写調節 (他9件)
【概要】代表的な二つの研究成果について述べる。 (1)真核生物遺伝子のプロモーターデータベースである"EPD(eukaryotic promoter database)"に公開されているヒトのプロモーターのすべて(1871種)を対象として、DNAのフレキシビリティーを解析した。その結果、TATAボックスもイニシエーターも共に上流側が"柔らかい"配列で構成され、下流側は...
❏転写の開始段階に必須なクロマチン構造の実体解明(13680770)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2001 - 2002
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理工学部, 教授 (60268513)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写調節 (他6件)
【概要】本研究では、まず、一過的に導入されたレポーター上に細胞核内で形成されるクロマチン構造を解析した。レポーターには、負の超らせんを擬態した176bpの人工ベントDNA(T20)をもつ単純ヘルペスウィルスtkプロモーター、T20をもつヒトhsp70Bプロモーター、ならびに左方向に緩やかにねじれた構造をとったマウスpgk-1プロモーターを用いた。T20は、我々が構築したベントDNAであり、細胞内でtkプロ...
❏真核細胞プロモーターにおけるベントDNAの機能発現メカニズムの解析(09680681)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】1997 - 1998
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理学部, 助教授 (60268513)
【キーワード】ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写制御 / クロマチン / ヌクレオソーム (他8件)
【概要】本研究では、人工合成したベントDNAとヘルペス単純ウイルスのチミジンキナーゼ(tk)プロモーターまたはヒトアデノウイルス2型E1A遺伝子プロモーターを用いて、50種類にものぼる組換え体を作製し、ベントDNAの形、プロモーターに対する回転上の配向、そしてその存在位置がプロモーターの活性に与える影響について、系統的な解析を行った。その結果、プロモーターを活性化できるベントDNAの形を解明し、加えて、プ...
【工学】プロセス・化学工学：ヒストン ／ヌクレオソームを含む研究件
❏中区分37:生体分子化学およびその関連分野(0)
【研究テーマ】2018
【研究種目】ヌクレオソーム
【研究期間】DNA
【研究代表者】クロマチン
【キーワード】ヒストン
【概要】
❏ミニ染色体モデルの化学合成と機能解析(19K22245)
【研究テーマ】
【研究種目】挑戦的研究(萌芽)
【研究期間】2019-06-28 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】化学合成 / クロマチン / DNA / ヒストン / ペプチド (他10件)
【概要】（1）ミニ染色体モデルの化学合成…連結するDNAユニットの合成まで完成した。DNAユニット2種類あり、各々Widom601DNA配列を含めた。ユニットの末端は突出末端になっており、制限酵素に対応した配列を有する。 （2）ミニ染色体モデルに含まれる機能性ヒストンの化学合成…大気中でも安定な有機ルテニウム触媒を用いて、ワンポットで複数のペプチドを連結する方法を開発した。有機ルテニウム触媒は、従来のパラ...
❏スーパーヌクレオソーム構築による1細胞エピジェネティック修飾マッピング(18H03931)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】ヌクレオソーム / DNA / クロマチン / ヒストン / パラジウム (他14件)
【概要】（1）人工ヌクレオソームの化学的製造法の確立…有機金属錯体を用いた新たなペプチドライゲーション法を確立して、コアヒストン4種類（H2A, H2B, H3, H4）およびリンカーヒストンH1の合成を行った。 （2）スーパーヌクレオソームの創出…原子による細胞機能制御の本質を見抜くために、タンパク質修飾法を検討して、天然にはない機能を付与した「スーパーヌクレオソーム」を化学合成する方法を確立した。 ...
【農学】森林圏科学：酵母 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏転写制御におけるクロマチンダイナミズムを規定するシス及びトランス因子の機能解析(21570185)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2009 - 2011
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】遺伝子 / 発現制御 / ゲノム / クロマチン / ヌクレオソーム (他10件)
【概要】遺伝子発現におけるクロマチン機能に関する重要な問題の一つは、ヌクレオソームの配置決定とそのダイナミクスの機構である。本研究では、転写制御に着目し、出芽酵母ゲノム及びミニ染色体において、ヌクレオソームの配置を規定するシス因子としていくつかのDNAリピート配列を同定した。また、トランス因子としてクロマチンリモデリングIsw2複合体、ヒストン脱アセチル化酵素Rpd3、ピストンH3バリアントの機能を解析し...
❏遺伝情報の発現を制御するクロマチンドメインの分子構築と動態(19570169)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2007 - 2008
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】ゲノム / 遺伝子 / 発現制御 / 転写制御 / クロマチン (他8件)
【概要】真核生物のゲノムDNAはヒストンと結合し、ヌクレオソーム、クロマチンとして核内に収納されている。遺伝子発現におけるクロマチンの機能を明らかにすることを目的として、まず、ヒト由来His_6タグ付ヒストンH3バリアントを酵母で発現させ、それを含む酵母ミニ染色体を容易に精製する系を構築した。さらに、ゲノム遺伝子座におけるヌクレオソーム配置のダイナミックな変化が、転写制御に本質的な機能を有することを示した...
【医歯薬学】基礎医学：クライオ電子顕微鏡 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏小区分43050:ゲノム生物学関連(0)
【研究テーマ】2019
【研究種目】ヘテロクロマチン
【研究期間】ヌクレオソーム
【研究代表者】クライオ電子顕微鏡
【キーワード】エピジェネティクス
【概要】DNAの遺伝情報をRNAに転写する巨大なタンパク質複合体であるRNAポリメラーゼは、細胞内の様々な分子と相互作用し、多くの生命機能を支えるハブとして機能している。しかしながら、これらの諸機能と転写との接点で形成される分子の実体やその構造、機能や制御のメカニズムはほとんど分かっていない。RNAポリメラーゼを中心に形成される超複合体の構造解析を行うことを目指し、以下の研究に着手した。 RNAポリメラー...
❏クロマチン構成因子DEKによるクロマチン構造制御機構の解明(19K21177)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】鯨井 智也 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (70823566)
【キーワード】クロマチン / DEK / 癌 / ヌクレオソーム / エピジェネティクス (他7件)
【概要】遺伝情報の担体であるゲノムDNAは、クロマチン構造をとって細胞核内に収納されている。クロマチン構成因子であり、がん遺伝子であるDEKは、クロマチン構造に作用することで、転写、スプライシング、DNA修復などの多様な核内プロセスに関与し、クロマチンの恒常性を担保すると考えられている。そこで本研究では、DEKが形成するクロマチン構造を解明することを目的とし、DEK-クロマチン複合体を試験管内において再構...
❏ヒストンメチル基転移酵素SUV39H1を含むヘテロクロマチン様複合体の構造解析(19K06609)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31
【研究代表者】佐藤 祥子 東京大学, 定量生命科学研究所, 特任助教 (90624966)
【キーワード】ヘテロクロマチン / ヌクレオソーム / クライオ電子顕微鏡 / エピジェネティクス
【概要】真核生物のゲノムDNAは、ヌクレオソームを基本単位としてクロマチンを形成し、構造的・機能的に異なる区画を形成して遺伝子発現やゲノムの安定性を制御している。本研究では、構成的ヘテロクロマチンのエピジェネティックマークの書き込み因子であるSUV39Hと、読み取り因子であるヘテロクロマチンタンパク質HP1、およびヌクレオソームとで形成される複合体の立体構造を解析することにより、ヘテロクロマチン形成の機構...
【医歯薬学】内科系臨床医学：セントロメア ／ヌクレオソームを含む研究件
❏Ｘ線及び中性子溶液散乱法による高次ヌクレオソーム複合体の動態構造解析(25291037)
【研究テーマ】生物物理学
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31
【研究代表者】佐藤 衛 横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (60170784)
【キーワード】溶液散乱 / 小角散乱 / クロマチン / ヌクレオソーム / セントロメア (他7件)
【概要】Ｘ線・中性子溶液散乱解析から、H2A.Bモノ・ヌクレオソームのDNAは両端がヒストン8量体からはがれていることを実証し、この性質によりH2A.Bは緩んだ状態のクロマチンが形成できることを示した。また、H3およびH3のバリアント（CENP-A）を含むヌクレオソームが３つ連結した高次ヌクレオソーム複合体（H3-CA-H3トリ・ヌクレオソーム）のＸ線溶液散乱解析からH3-CA-H3トリ・ヌクレオソームが...
❏セントロメア領域のクロマチン構造基盤の解析(23770008)
【研究テーマ】遺伝・ゲノム動態
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2011 - 2012
【研究代表者】立和名 博昭 早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員 (70546382)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / セントロメア / CENP-A / CENP-B (他8件)
【概要】ゲノムDNAは、遺伝情報を担う重要な物質である。細胞の分裂に伴い、ゲノムDNAは正確に継承されなくてはならない。そのため、S期で複製され倍加したゲノムDNAを、2つの娘細胞に均等に分配する機構が存在する。この均等分配機構の詳細は明らかとなっていないが、ゲノムDNA上の領域であるセントロメア領域が重要な役割を果たしている。セントロメア領域のクロマチン構造が、セントロメア領域の機能発現に重要であると考...
❏セントロメア領域に特異的なヌクレオソームの結晶構造解析(21870038)
【研究テーマ】生物物理学
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2009 - 2010
【研究代表者】立和名 博昭 早稲田大学, 理工学術院, 助教 (70546382)
【キーワード】クロマチン / セントロメア / ヌクレオソーム / ヒストン / ヒストンバリアント (他7件)
【概要】本研究では、真核生物のセントロメア領域の主要な構成因子であるヒストンH3バリアントCENP-Aを含むヌクレオソームの立体構造を明らかにした。本構造解析によりCENP-Aヌクレオソームは各二分子のヒストンCENP-A、H4、H2AおよびH2Bからなるヒストン八量体にDNAが左巻きに結合していることが明らかとなった。またCENP-Aヌクレオソームでは、ヒストン八量体に安定に結合しているDNA の長さが...
【医歯薬学】内科系臨床医学：プロモーター ／ヌクレオソームを含む研究件
❏転写開始のためのクロマチン基盤構造の構築機構:ベントDNAが担う役割の解明(15570147)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2003 - 2004
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理工学部, 教授 (60268513)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写調節 (他9件)
【概要】代表的な二つの研究成果について述べる。 (1)真核生物遺伝子のプロモーターデータベースである"EPD(eukaryotic promoter database)"に公開されているヒトのプロモーターのすべて(1871種)を対象として、DNAのフレキシビリティーを解析した。その結果、TATAボックスもイニシエーターも共に上流側が"柔らかい"配列で構成され、下流側は...
❏転写の開始段階に必須なクロマチン構造の実体解明(13680770)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2001 - 2002
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理工学部, 教授 (60268513)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写調節 (他6件)
【概要】本研究では、まず、一過的に導入されたレポーター上に細胞核内で形成されるクロマチン構造を解析した。レポーターには、負の超らせんを擬態した176bpの人工ベントDNA(T20)をもつ単純ヘルペスウィルスtkプロモーター、T20をもつヒトhsp70Bプロモーター、ならびに左方向に緩やかにねじれた構造をとったマウスpgk-1プロモーターを用いた。T20は、我々が構築したベントDNAであり、細胞内でtkプロ...
❏真核細胞プロモーターにおけるベントDNAの機能発現メカニズムの解析(09680681)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】1997 - 1998
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理学部, 助教授 (60268513)
【キーワード】ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写制御 / クロマチン / ヌクレオソーム (他8件)
【概要】本研究では、人工合成したベントDNAとヘルペス単純ウイルスのチミジンキナーゼ(tk)プロモーターまたはヒトアデノウイルス2型E1A遺伝子プロモーターを用いて、50種類にものぼる組換え体を作製し、ベントDNAの形、プロモーターに対する回転上の配向、そしてその存在位置がプロモーターの活性に与える影響について、系統的な解析を行った。その結果、プロモーターを活性化できるベントDNAの形を解明し、加えて、プ...
【医歯薬学】外科系臨床医学：クロマチン ／ヌクレオソームを含む研究件
❏0701:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野(0)
【研究テーマ】2019
【研究種目】クロマチン
【研究期間】非コードRNA
【研究代表者】転写制御
【キーワード】ヌクレオソーム
【概要】
❏自然免疫DNAセンサーによるクロマチンの認識と構造制御機構の解明(20K15711)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2020-04-01 - 2022-03-31
【研究代表者】鯨井 智也 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (70823566)
【キーワード】クロマチン / cGAS / ヌクレオソーム / 自然免疫 / DNAセンサー (他6件)
【概要】脊椎動物では、ウイルスなどの外来DNAに対する防衛するため、自然免疫のDNAセンサーcGASを備えている。一方で細胞は、自身の設計図であるゲノムDNAを持つため、cGASは、自身のクロマチンを形成したDNAに対しては不活化しなければならない。本研究では、クロマチンの基本単位であるヌクレオソームとcGAS複合体の立体構造をクライオ電子顕微鏡解析により決定した。本研究結果によって、ヌクレオソームによる...
❏非コードRNAによるクロマチン転写制御機構(19K23714)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】藤田 理紗 東京大学, 定量生命科学研究所, 特任研究員 (10845291)
【キーワード】クロマチン / 非コードRNA / 転写制御 / ヌクレオソーム / エピジェネティクス
【概要】真核生物のゲノムDNAはクロマチン構造を形成して核内に収納されている。本研究では、非コードRNAがクロマチン上の転写を制御する機構の解明を目的とした。そこで、非コードRNAが引き起こすヌクレオソーム構造の変化および非コードRNAによるRNAポリメラーゼIIの転写活性への影響を構造生物学的および生化学的解析を行った。その結果として、非コードRNAがヌクレオソームの安定性を変化させることを明らかにした...
【医歯薬学】外科系臨床医学：染色体 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏ミニ染色体モデルの化学合成と機能解析(19K22245)
【研究テーマ】
【研究種目】挑戦的研究(萌芽)
【研究期間】2019-06-28 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】化学合成 / クロマチン / DNA / ヒストン / ペプチド (他10件)
【概要】（1）ミニ染色体モデルの化学合成…連結するDNAユニットの合成まで完成した。DNAユニット2種類あり、各々Widom601DNA配列を含めた。ユニットの末端は突出末端になっており、制限酵素に対応した配列を有する。 （2）ミニ染色体モデルに含まれる機能性ヒストンの化学合成…大気中でも安定な有機ルテニウム触媒を用いて、ワンポットで複数のペプチドを連結する方法を開発した。有機ルテニウム触媒は、従来のパラ...
❏セントロメア領域のクロマチン構造基盤の解析(23770008)
【研究テーマ】遺伝・ゲノム動態
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2011 - 2012
【研究代表者】立和名 博昭 早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員 (70546382)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / セントロメア / CENP-A / CENP-B (他8件)
【概要】ゲノムDNAは、遺伝情報を担う重要な物質である。細胞の分裂に伴い、ゲノムDNAは正確に継承されなくてはならない。そのため、S期で複製され倍加したゲノムDNAを、2つの娘細胞に均等に分配する機構が存在する。この均等分配機構の詳細は明らかとなっていないが、ゲノムDNA上の領域であるセントロメア領域が重要な役割を果たしている。セントロメア領域のクロマチン構造が、セントロメア領域の機能発現に重要であると考...
【医歯薬学】薬学：化学合成 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏ミニ染色体モデルの化学合成と機能解析(19K22245)
【研究テーマ】
【研究種目】挑戦的研究(萌芽)
【研究期間】2019-06-28 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】化学合成 / クロマチン / DNA / ヒストン / ペプチド (他10件)
【概要】（1）ミニ染色体モデルの化学合成…連結するDNAユニットの合成まで完成した。DNAユニット2種類あり、各々Widom601DNA配列を含めた。ユニットの末端は突出末端になっており、制限酵素に対応した配列を有する。 （2）ミニ染色体モデルに含まれる機能性ヒストンの化学合成…大気中でも安定な有機ルテニウム触媒を用いて、ワンポットで複数のペプチドを連結する方法を開発した。有機ルテニウム触媒は、従来のパラ...
❏スーパーヌクレオソーム構築による1細胞エピジェネティック修飾マッピング(18H03931)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】ヌクレオソーム / DNA / クロマチン / ヒストン / パラジウム (他14件)
【概要】（1）人工ヌクレオソームの化学的製造法の確立…有機金属錯体を用いた新たなペプチドライゲーション法を確立して、コアヒストン4種類（H2A, H2B, H3, H4）およびリンカーヒストンH1の合成を行った。 （2）スーパーヌクレオソームの創出…原子による細胞機能制御の本質を見抜くために、タンパク質修飾法を検討して、天然にはない機能を付与した「スーパーヌクレオソーム」を化学合成する方法を確立した。 ...
【医歯薬学】薬学：ぺプチド ／ヌクレオソームを含む研究件
❏ミニ染色体モデルの化学合成と機能解析(19K22245)
【研究テーマ】
【研究種目】挑戦的研究(萌芽)
【研究期間】2019-06-28 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】化学合成 / クロマチン / DNA / ヒストン / ペプチド (他10件)
【概要】（1）ミニ染色体モデルの化学合成…連結するDNAユニットの合成まで完成した。DNAユニット2種類あり、各々Widom601DNA配列を含めた。ユニットの末端は突出末端になっており、制限酵素に対応した配列を有する。 （2）ミニ染色体モデルに含まれる機能性ヒストンの化学合成…大気中でも安定な有機ルテニウム触媒を用いて、ワンポットで複数のペプチドを連結する方法を開発した。有機ルテニウム触媒は、従来のパラ...
❏スーパーヌクレオソーム構築による1細胞エピジェネティック修飾マッピング(18H03931)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】ヌクレオソーム / DNA / クロマチン / ヒストン / パラジウム (他14件)
【概要】（1）人工ヌクレオソームの化学的製造法の確立…有機金属錯体を用いた新たなペプチドライゲーション法を確立して、コアヒストン4種類（H2A, H2B, H3, H4）およびリンカーヒストンH1の合成を行った。 （2）スーパーヌクレオソームの創出…原子による細胞機能制御の本質を見抜くために、タンパク質修飾法を検討して、天然にはない機能を付与した「スーパーヌクレオソーム」を化学合成する方法を確立した。 ...
【医歯薬学】薬学：DNA ／ヌクレオソームを含む研究件
❏ミニ染色体モデルの化学合成と機能解析(19K22245)
【研究テーマ】
【研究種目】挑戦的研究(萌芽)
【研究期間】2019-06-28 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】化学合成 / クロマチン / DNA / ヒストン / ペプチド (他10件)
【概要】（1）ミニ染色体モデルの化学合成…連結するDNAユニットの合成まで完成した。DNAユニット2種類あり、各々Widom601DNA配列を含めた。ユニットの末端は突出末端になっており、制限酵素に対応した配列を有する。 （2）ミニ染色体モデルに含まれる機能性ヒストンの化学合成…大気中でも安定な有機ルテニウム触媒を用いて、ワンポットで複数のペプチドを連結する方法を開発した。有機ルテニウム触媒は、従来のパラ...
❏スーパーヌクレオソーム構築による1細胞エピジェネティック修飾マッピング(18H03931)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2018-04-01 - 2021-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】ヌクレオソーム / DNA / クロマチン / ヒストン / パラジウム (他14件)
【概要】（1）人工ヌクレオソームの化学的製造法の確立…有機金属錯体を用いた新たなペプチドライゲーション法を確立して、コアヒストン4種類（H2A, H2B, H3, H4）およびリンカーヒストンH1の合成を行った。 （2）スーパーヌクレオソームの創出…原子による細胞機能制御の本質を見抜くために、タンパク質修飾法を検討して、天然にはない機能を付与した「スーパーヌクレオソーム」を化学合成する方法を確立した。 ...
❏階層性をもつ複雑分子システムの集団運動の機構解明(21840051)
【研究テーマ】生物物理・化学物理
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2009 - 2010
【研究代表者】柳尾 朋洋 早稲田大学, 理工学術院, 講師 (40444450)
【キーワード】非線形力学 / 幾何学 / クラスター / DNA / 集団運動 (他18件)
【概要】本研究プロジェクトでは、高度な秩序構造を有する複雑分子システムの集団運動と機能発現の仕組みを、非線形力学と幾何学の観点から解き明かす研究を推進した。特に、原子・分子のクラスター(集合体)の構造変化の機構と速度過程を、分子内モード結合とエネルギー移動の観点から明らかにした。さらに、生物のDNAがもつユニークな弾性特性と、DNAの高次構造形成における右・左(キラリティ)の自発的選択のメカニズムの一端を...
【医歯薬学】薬学：発現制御 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏転写制御におけるクロマチンダイナミズムを規定するシス及びトランス因子の機能解析(21570185)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2009 - 2011
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】遺伝子 / 発現制御 / ゲノム / クロマチン / ヌクレオソーム (他10件)
【概要】遺伝子発現におけるクロマチン機能に関する重要な問題の一つは、ヌクレオソームの配置決定とそのダイナミクスの機構である。本研究では、転写制御に着目し、出芽酵母ゲノム及びミニ染色体において、ヌクレオソームの配置を規定するシス因子としていくつかのDNAリピート配列を同定した。また、トランス因子としてクロマチンリモデリングIsw2複合体、ヒストン脱アセチル化酵素Rpd3、ピストンH3バリアントの機能を解析し...
❏遺伝情報の発現を制御するクロマチンドメインの分子構築と動態(19570169)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2007 - 2008
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】ゲノム / 遺伝子 / 発現制御 / 転写制御 / クロマチン (他8件)
【概要】真核生物のゲノムDNAはヒストンと結合し、ヌクレオソーム、クロマチンとして核内に収納されている。遺伝子発現におけるクロマチンの機能を明らかにすることを目的として、まず、ヒト由来His_6タグ付ヒストンH3バリアントを酵母で発現させ、それを含む酵母ミニ染色体を容易に精製する系を構築した。さらに、ゲノム遺伝子座におけるヌクレオソーム配置のダイナミックな変化が、転写制御に本質的な機能を有することを示した...
【医歯薬学】薬学：転写制御 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏非コードRNAによるクロマチン転写制御機構(19K23714)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】藤田 理紗 東京大学, 定量生命科学研究所, 特任研究員 (10845291)
【キーワード】クロマチン / 非コードRNA / 転写制御 / ヌクレオソーム / エピジェネティクス
【概要】真核生物のゲノムDNAはクロマチン構造を形成して核内に収納されている。本研究では、非コードRNAがクロマチン上の転写を制御する機構の解明を目的とした。そこで、非コードRNAが引き起こすヌクレオソーム構造の変化および非コードRNAによるRNAポリメラーゼIIの転写活性への影響を構造生物学的および生化学的解析を行った。その結果として、非コードRNAがヌクレオソームの安定性を変化させることを明らかにした...
❏転写制御におけるクロマチンダイナミズムを規定するシス及びトランス因子の機能解析(21570185)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2009 - 2011
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】遺伝子 / 発現制御 / ゲノム / クロマチン / ヌクレオソーム (他10件)
【概要】遺伝子発現におけるクロマチン機能に関する重要な問題の一つは、ヌクレオソームの配置決定とそのダイナミクスの機構である。本研究では、転写制御に着目し、出芽酵母ゲノム及びミニ染色体において、ヌクレオソームの配置を規定するシス因子としていくつかのDNAリピート配列を同定した。また、トランス因子としてクロマチンリモデリングIsw2複合体、ヒストン脱アセチル化酵素Rpd3、ピストンH3バリアントの機能を解析し...
❏遺伝情報の発現を制御するクロマチンドメインの分子構築と動態(19570169)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2007 - 2008
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】ゲノム / 遺伝子 / 発現制御 / 転写制御 / クロマチン (他8件)
【概要】真核生物のゲノムDNAはヒストンと結合し、ヌクレオソーム、クロマチンとして核内に収納されている。遺伝子発現におけるクロマチンの機能を明らかにすることを目的として、まず、ヒト由来His_6タグ付ヒストンH3バリアントを酵母で発現させ、それを含む酵母ミニ染色体を容易に精製する系を構築した。さらに、ゲノム遺伝子座におけるヌクレオソーム配置のダイナミックな変化が、転写制御に本質的な機能を有することを示した...
【医歯薬学】薬学：転写調節 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏転写開始のためのクロマチン基盤構造の構築機構:ベントDNAが担う役割の解明(15570147)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2003 - 2004
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理工学部, 教授 (60268513)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写調節 (他9件)
【概要】代表的な二つの研究成果について述べる。 (1)真核生物遺伝子のプロモーターデータベースである"EPD(eukaryotic promoter database)"に公開されているヒトのプロモーターのすべて(1871種)を対象として、DNAのフレキシビリティーを解析した。その結果、TATAボックスもイニシエーターも共に上流側が"柔らかい"配列で構成され、下流側は...
❏転写の開始段階に必須なクロマチン構造の実体解明(13680770)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2001 - 2002
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理工学部, 教授 (60268513)
【キーワード】クロマチン / ヌクレオソーム / ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写調節 (他6件)
【概要】本研究では、まず、一過的に導入されたレポーター上に細胞核内で形成されるクロマチン構造を解析した。レポーターには、負の超らせんを擬態した176bpの人工ベントDNA(T20)をもつ単純ヘルペスウィルスtkプロモーター、T20をもつヒトhsp70Bプロモーター、ならびに左方向に緩やかにねじれた構造をとったマウスpgk-1プロモーターを用いた。T20は、我々が構築したベントDNAであり、細胞内でtkプロ...
❏真核細胞プロモーターにおけるベントDNAの機能発現メカニズムの解析(09680681)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】1997 - 1998
【研究代表者】大山 隆 甲南大学, 理学部, 助教授 (60268513)
【キーワード】ベントDNA(bent DNA) / プロモーター / 転写制御 / クロマチン / ヌクレオソーム (他8件)
【概要】本研究では、人工合成したベントDNAとヘルペス単純ウイルスのチミジンキナーゼ(tk)プロモーターまたはヒトアデノウイルス2型E1A遺伝子プロモーターを用いて、50種類にものぼる組換え体を作製し、ベントDNAの形、プロモーターに対する回転上の配向、そしてその存在位置がプロモーターの活性に与える影響について、系統的な解析を行った。その結果、プロモーターを活性化できるベントDNAの形を解明し、加えて、プ...
【医歯薬学】看護学：エピジェネテイクス ／ヌクレオソームを含む研究件
❏0701:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野(0)
【研究テーマ】2019
【研究種目】クロマチン
【研究期間】DEK
【研究代表者】癌
【キーワード】ヌクレオソーム
【概要】
❏非コードRNAによるクロマチン転写制御機構(19K23714)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】藤田 理紗 東京大学, 定量生命科学研究所, 特任研究員 (10845291)
【キーワード】クロマチン / 非コードRNA / 転写制御 / ヌクレオソーム / エピジェネティクス
【概要】真核生物のゲノムDNAはクロマチン構造を形成して核内に収納されている。本研究では、非コードRNAがクロマチン上の転写を制御する機構の解明を目的とした。そこで、非コードRNAが引き起こすヌクレオソーム構造の変化および非コードRNAによるRNAポリメラーゼIIの転写活性への影響を構造生物学的および生化学的解析を行った。その結果として、非コードRNAがヌクレオソームの安定性を変化させることを明らかにした...
❏クロマチン構成因子DEKによるクロマチン構造制御機構の解明(19K21177)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】鯨井 智也 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (70823566)
【キーワード】クロマチン / DEK / 癌 / ヌクレオソーム / エピジェネティクス (他7件)
【概要】遺伝情報の担体であるゲノムDNAは、クロマチン構造をとって細胞核内に収納されている。クロマチン構成因子であり、がん遺伝子であるDEKは、クロマチン構造に作用することで、転写、スプライシング、DNA修復などの多様な核内プロセスに関与し、クロマチンの恒常性を担保すると考えられている。そこで本研究では、DEKが形成するクロマチン構造を解明することを目的とし、DEK-クロマチン複合体を試験管内において再構...
【医歯薬学】看護学：遺伝子 ／ヌクレオソームを含む研究件
❏転写制御におけるクロマチンダイナミズムを規定するシス及びトランス因子の機能解析(21570185)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2009 - 2011
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】遺伝子 / 発現制御 / ゲノム / クロマチン / ヌクレオソーム (他10件)
【概要】遺伝子発現におけるクロマチン機能に関する重要な問題の一つは、ヌクレオソームの配置決定とそのダイナミクスの機構である。本研究では、転写制御に着目し、出芽酵母ゲノム及びミニ染色体において、ヌクレオソームの配置を規定するシス因子としていくつかのDNAリピート配列を同定した。また、トランス因子としてクロマチンリモデリングIsw2複合体、ヒストン脱アセチル化酵素Rpd3、ピストンH3バリアントの機能を解析し...
❏遺伝情報の発現を制御するクロマチンドメインの分子構築と動態(19570169)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2007 - 2008
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】ゲノム / 遺伝子 / 発現制御 / 転写制御 / クロマチン (他8件)
【概要】真核生物のゲノムDNAはヒストンと結合し、ヌクレオソーム、クロマチンとして核内に収納されている。遺伝子発現におけるクロマチンの機能を明らかにすることを目的として、まず、ヒト由来His_6タグ付ヒストンH3バリアントを酵母で発現させ、それを含む酵母ミニ染色体を容易に精製する系を構築した。さらに、ゲノム遺伝子座におけるヌクレオソーム配置のダイナミックな変化が、転写制御に本質的な機能を有することを示した...
【医歯薬学】看護学：ゲノム ／ヌクレオソームを含む研究件
❏転写制御におけるクロマチンダイナミズムを規定するシス及びトランス因子の機能解析(21570185)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2009 - 2011
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】遺伝子 / 発現制御 / ゲノム / クロマチン / ヌクレオソーム (他10件)
【概要】遺伝子発現におけるクロマチン機能に関する重要な問題の一つは、ヌクレオソームの配置決定とそのダイナミクスの機構である。本研究では、転写制御に着目し、出芽酵母ゲノム及びミニ染色体において、ヌクレオソームの配置を規定するシス因子としていくつかのDNAリピート配列を同定した。また、トランス因子としてクロマチンリモデリングIsw2複合体、ヒストン脱アセチル化酵素Rpd3、ピストンH3バリアントの機能を解析し...
❏遺伝情報の発現を制御するクロマチンドメインの分子構築と動態(19570169)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2007 - 2008
【研究代表者】清水 光弘 明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
【キーワード】ゲノム / 遺伝子 / 発現制御 / 転写制御 / クロマチン (他8件)
【概要】真核生物のゲノムDNAはヒストンと結合し、ヌクレオソーム、クロマチンとして核内に収納されている。遺伝子発現におけるクロマチンの機能を明らかにすることを目的として、まず、ヒト由来His_6タグ付ヒストンH3バリアントを酵母で発現させ、それを含む酵母ミニ染色体を容易に精製する系を構築した。さらに、ゲノム遺伝子座におけるヌクレオソーム配置のダイナミックな変化が、転写制御に本質的な機能を有することを示した...
© 2024 ARchiTect inc. All rights reserved.