マイクロＲＮＡおよびｓｎｏＲＮＡとその標的の網羅的予測
【研究分野】生体生命情報学
【研究キーワード】
バイオインフォマティクス / 機能性RNA / RNA / snoRNA / マイクロRNA / 確率モデル / RNA-RNA相互作用
【研究成果の概要】
本研究では、主として以下の成果を得た。（a）新しいマイクロRNA予測ツールを開発し、既存のツールよりも、誤検出が少ないことを示した。(b)二次構造的なアクセシビリティを検出するツールを開発し、ゲノム上のマイクロRNA結合サイト周辺に働く二次構造的な制約を検出した。(c)変異による構造エネルギーや揺らぎの変化を計算するツールを開発した。これを用いて、ミトコンドリアtRNAの解析を行い、構造揺らぎの増加が疾患と相関することを示した。(d)RNA配列の各位置の構造的文脈を予測するツールを開発し、RNA結合たんぱく質の結合領域周辺の構造的な特異性を検出した。
【研究代表者】
【研究分担者】 |
| 木立 尚孝 | 東京大学 | 大学院新領域創成科学研究科 | 准教授 | (Kakenデータベース) |
| 廣瀬 哲郎 | 北海道大学 | 遺伝子病制御研究所 | 教授 | (Kakenデータベース) |
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【研究連携者】 |
| 佐藤 健吾 | 慶應義塾大学 | 理工学部 | 講師 | (Kakenデータベース) |
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【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2010-04-01 - 2013-03-31
【配分額】46,410千円 (直接経費: 35,700千円、間接経費: 10,710千円)