横浜市立大学 研究シーズ|
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研究キーワード：横浜市立大学における「酵素反応」 に関係する研究一覧：2件
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発表日：2026年7月28日
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細胞内の膜を「安全に壊す」仕組みを解明
—オートファジーを支える脂質分解酵素Atg15の活性化と膜曲率認識—
1．タンパク質の切断と膜結合で活性中心が開く 研究グループは、AlphaFold＊４による構造予測を出発点に、全原子分子動力学シミュレーション＊５を行いました。その結果、C末端が切断されていないAtg15では、タンパク質表面に露出した疎水性領域HR1〜HR4が互いにかみ合い、酵素反応を担う活性中心が閉じた状態に固定されることが示されました。一方、液胞内のタンパク質分解酵素によってC末端が切断され、HR4が取り除かれると、この固定が弱まり、Atg15は開いた状態をとることができるようになりました。さらに膜へ結合すると、HR...
キーワード：スーパーコンピュータ/人工知能（AI）/品質管理/分子動力学シミュレーション/数値計算/スルフィド/Atg/オルガネラ/ジスルフィド結合/前駆体/選択性/持続可能/持続可能な開発/シミュレーション/制御工学/動力学/分子シミュレーション/分子動力学/膜構造/親水性/構造予測/オートファゴソーム/システイン/嗜好性/酵素活性/アミノ酸配列/リパーゼ/酵素反応/分子機構/アミノ酸/イミン/オートファジー/タンパク質分解/ホスホリパーゼ/リソソーム/リン脂質/構造変化/脂肪酸/立体構造/脂質/脂質代謝
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2026年7月3日
2
「ごちゃまぜ法」でペプチドを修飾する新規酵素を一挙に探索
—ペプチドへの脂質付加を可能にする酵素レパートリーの拡張—
京都大学大学院理学研究科 後藤佑樹 教授、東京大学大学院理学系研究科の菅裕明 教授、佐竹真幸 准教授、横浜市立大学大学院医学研究科仙石徹 准教授、濱田恵輔 助教、神奈川大学化学生命学部 岡田正弘 教授らの研究グループは、ペプチドに...
キーワード：最適化/先端技術/SPring-8/バクテリア/放射光/太陽/機能性分子/シアノバクテリア/結晶構造解析/質量分析/共結晶/選択性/生体内/機能性/基質特異性/結晶構造/酵素活性/モチベーション/機能解析/酵素反応/ホルモン/神経伝達物質/アミノ酸/ケミカルバイオロジー/スクリーニング/トリプトファン/ラット/医薬品開発/構造変化/生理活性/創薬/立体構造/立体構造解析/ゲノム/脂質
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学