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研究キーワード:東北大学における「トランスクリプトーム」 に関係する研究一覧:5件
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発表日:2026年9月9日
1
微生物群集をデザインして植物を強くする
―機械学習でトマト生育を促進する微生物群集を設計・実証―
植物の生育を促す有用な微生物は数多く見つかっていますが、複数の微生物をどのように組み合わせれば高い効果が得られるかを効率的に予測・設計することは困難でした。青木裕一 東北大学講師、山﨑真一 同研究員(現、理化学研究所 研究員)、杉山暁史 京都大学教授、中安大 同研究員、白須賢 理化学研究所グループディレクター、増田幸子 同研究員らの研究グループは、微生物の組み合わせに加えて、微生物の遺伝子情報、植物由来成分、栽培温度などの情報を機械学習で統合し、植物の生育を促す微生物コミュニティを予測・設計する手法を開発しました(図1)。設計した微生物コミュニティは、実験室での高温条件下および屋外...
キーワード:機械学習/人工知能(AI)/生体情報/環境変動/微生物群集/生物群集/持続可能/持続可能な開発/マイクロ/トマト/農地/微生物/微生物叢/オミクス/オミクス解析/マルチオミクス/マルチオミクス解析/トランスクリプトーム/コミュニティ/マイクロバイオーム/遺伝子/遺伝子発現
他の関係分野:情報学環境学生物学工学農学
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発表日:2026年6月18日
2
老化・慢性疾患・若返りに共通する「死亡リスクを推定する指標」を開発
―RNA-seqデータから加齢を測定―
老化は慢性疾患の主要な危険因子ですが、同年齢でも進行には個人差があり、それを正確に測定する指標が求められてきました。従来のエピジェネティック時計には遺伝子活動や時空間的変化の評価に限界がありました。東北大学大学院医学系研究科・医工学研究科の阿部高明教授らの研究グループは AMEDムーンショット型研究開発事業「ミトコンドリア先制医療」の国際共同研究先であるBrigham and Women's Hospital / Harvard Medical SchoolのVadim N. Gladyshev教授らとの共同研究により、米国国立老化研究所(NIA)のInterventions Te...
キーワード:ネットワーク解析/プロトコル/ヒトデ/持続可能/持続可能な開発/リスク評価/医工学/一細胞/若返り/死亡率/寿命/次世代シーケンサー/DNAメチル化/RNA/トランスクリプトーム/マウス/ミトコンドリア/メチル化/血液/免疫応答/遺伝子/遺伝子発現/加齢/危険因子/健康寿命/脂質/脂質代謝/慢性疾患/老化
他の関係分野:情報学生物学工学総合生物
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発表日:2026年5月13日
3
妊娠初期の低栄養が統合失調症リスクを高める可能性
-飢餓と精神疾患を繋ぐ分子基盤をモデル動物で解明へ-
妊娠期の低栄養が子の統合失調症リスクを高める可能性が、これまでの疫学研究から示唆されてきました。しかし、その根本的なメカニズムは明らかになっていませんでした。東北大学大学院医学系研究科器官解剖学分野の王 泓博大学院生、大和田祐二教授、前川素子准教授らの研究グループは、妊娠初期低栄養モデルマウスを作製し、生まれた雄の仔において統合失調症に類似した脳の変化と行動変化が生じることを明らかにしました(図1)。さらに、その背景に遺伝子の読み取り方を調節する「エピゲノム変化」が関与していることも示しました。本成果は、DOHaD仮説を支持する動物モデルを確立したものであり、統合失調症の...
キーワード:塩基配列/ヒストン/持続可能/持続可能な開発/シナプス/スパイン/樹状突起スパイン/エピゲノム変化/精神医学/統合失調症/オミクス/オミクス解析/マルチオミクス/マルチオミクス解析/動物モデル/胎児/モデルマウス/解剖学/DNAメチル化/RNA/シナプス形成/トランスクリプトーム/ヒストン修飾/マウス/メチル化/モデル動物/細胞分裂/樹状突起/DOHaD/ゲノム/ストレス/遺伝子/遺伝子発現/疫学/疫学研究/新生児/精神疾患/低栄養/妊娠
他の関係分野:生物学工学総合生物
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発表日:2025年7月30日
4
糖が「新しい脂肪細胞をつくるスイッチ」になる仕組みを解明
―脂肪のつき方を決める鍵となる酵素を同定―
脂肪細胞は食後の余剰エネルギーを蓄え、空腹時にそれを供給します。一般に脂肪の増加にはマイナスのイメージがありますが、必ずしも健康に悪いわけではありません。脂肪組織の増え方には、既存の脂肪細胞の肥大化(注6)と、新たな脂肪細胞をつくる増生があります。増生は代謝のバランスを保ち、炎症や糖尿病リスクを抑えますが、増生の詳細な制御機構は不明でした。東北大学大学院医学系研究科の酒井寿郎教授、秋田大学大学院医学系研究科の松村欣宏教授らの研究グループは、糖の代謝によって活性化される酵素JMJD1Aが、脂肪細胞を新たに生み出す増生に...
キーワード:環境変化/グルコース/遺伝情報/塩基配列/ヒストン/エネルギー消費/持続可能/持続可能な開発/抵抗性/性決定/肥満症/ヒストンメチル化/ヒストンメチル化酵素/ヒストン脱メチル化酵素/炎症反応/脂肪組織/ゲノム解析/脂肪細胞/内臓脂肪/エピゲノム解析/インスリン/トランスクリプトーム/マウス/メチル化/腫瘍形成/代謝物/低酸素/転写因子/インスリン抵抗性/ゲノム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/遺伝子発現/生理学/糖代謝/糖尿病
他の関係分野:複合領域生物学工学農学
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発表日:2025年7月14日
5
腸内細菌に頼った「肥満」が青色光耐性を生み出す
-適応的実験室進化による昆虫の新規耐性獲得メカニズムの特定-
作物保護における課題のひとつは、昆虫が迅速に進化し殺虫剤などに対する耐性を獲得する点であり、昆虫の進化プロセスの理解と新たな害虫防除技術の開発は農学における重要なミッションです。青色光毒性は多様な昆虫種に殺虫効果があり、化学農薬の代替手法として注目されています。東北大学大学院農学研究科の髙田悠太大学院生(現 産業技術総合研究所モレキュラーバイオシステム研究部門契約職員)、堀雅敏教授らの研究グループは、キイロショウジョウバエを用いた実験室選択によって、青色光毒性に対する昆虫の進化を観測しました。...
キーワード:青色光/持続可能/光照射/持続可能な開発/遺伝子操作/mRNA/ショウジョウバエ/トランスクリプトーム/抗生物質/発現制御/ゲノム/ストレス/遺伝学/遺伝子/細菌/脂質/腸内細菌
他の関係分野:生物学工学
東北大学 研究シーズ